地球百子第三季剧情故事设定于不久的将来，地球发生了一场核子战争，所有的文明被摧毁，而全球人口亦悉数灭亡，只有在12个太空站上工作和生活的400位居民能幸免于难。

　　如是者过了97年，人类亦在太空站繁衍了三代，幸存者的人数已经达到4000。为了确保所有幸存者都安全，12个太空站连为一体，并经过了适应性改造，而这个庞大的太空站被称作“方舟(The Ark)”。奈何太空站开始老化，生命支援系统已经无法修复，站内的氧气只够数月的使用。一班为数100的年轻罪犯被送往地面，试图探索地球是否再度适合居住。争权夺利，你虞我诈等人性弱点随即显露，人与人之间既定的秩序迅即瓦解。

地球百子第三季剧照

　　在全球性的核战过后，仅存的人类躲入空间站方舟中苟延残喘。为了保存资源，控制人口，任何触犯法律的成年人都会被处以死刑。将近一百年后，空间站氧气即将耗尽，人类面临死神的威胁。为此，包括少女克拉克(Eliza Taylor-Cotter 饰)、总理之子威尔斯(Eli Goree 饰)在内的一百名少年犯被强制送往地球，他们即使危急关头的牺牲品，也是人类最后的希望。

　　顺利抵达地球的年轻人急于摆脱方舟的束缚，克拉克则执意和几名同伴寻找供给，在此期间发现地球还有人类存在。另一方面，方舟内的政治局势波谲云诡，总理遇刺，代理总理凯恩(亨利·伊安·库斯克 Henry Ian Cusick 饰)蠢蠢欲动，人类的命运悬于一线。