特种兵之深入敌后剧情主要是讲述了在1942年的时候，一支特种兵深入敌内的背后故事。
1942年夏，日军攻势凶猛，英美军队撤出缅甸，中国军队炸毁惠通桥，以怒江天险阻隔日军，滇西缅甸陷落。日军利用丛林河流等便利，加紧构筑全方位的死亡天网，意图以滇缅地区为后盾，冲破怒江防线，阻断驼峰航线，攻占全中国。
一架美军飞机在撤离缅甸时遇袭坠毁，飞行员爱德华跳伞后失踪，美军派出搜救小队，不料消息泄露，小队落入日军重围，全军覆没，搜救行动失败。
特种兵之深入敌后剧照
中国方面派出地下党员洪长云率领的特战小队开展搜救，四名队员都是久经沙场，配合默契，有极高的军事素养和行动能力，再加上先进的美军武器极大提升了他们战斗力。
四人冲破日军防线，深入敌后，在当地少数民族和转战敌后的中国军队协助下，不仅救出英军战俘和爱德华，而且找出日军在滇缅丛林中布下的死亡天网，将其一举摧毁，为滇缅反攻胜利奠定基础。
