六块六毛六的那点事剧情以上世纪60年代为背景，讲述了一群被下放到北大荒的年轻人面临的情感抉择与命运变迁的故事。

　　留苏归来的武越打算找位临时女朋友，以抗拒家长对自己的工作安排。不料阴差阳错，对漂亮的饭店服务员马小勤一见钟情而不可自拔，拍出六块六毛六买酒只为博红颜一笑，而小勤正在为没钱给老妈买寿礼犯愁。捡破烂的老妈那姑是格格出身，打小吃惯的嘴，时逢困难岁月，经常扒在稻香村橱窗前盯着点心呑口水。心酸的小勤受精豆唆使，打算借用这六块六毛六为老妈还愿，买套稻香村的小八件为其贺寿。尚未成行，早就对小勤秀色垂涎的李经理抓住六块六毛六当成贪污事件相威胁，强奸马小勤未遂，准备强令其下放到兴凯湖农场劳动改造。

　　此时，武越继母王校长动员小勤的残废哥哥瘸二爷也去支援北大荒。武越为其打抱不平，和骂功卓绝、言语犀利、出手泼辣的那姑联手闹王府，竟结成忘年之交。那姑喜欢小伙子志向人品，有心给小勤撮合却遭女儿拒绝，武越亦遭到小勤男朋友臭子的抵毁与仇视。臭子对离开京城怀有恐惧感，却被指派下放兴凯湖当管理人员，他希望小勤能留在北京为自己将来返京留个门，不惜抛弃尊严叫马小勤向李经理低头。但性格执拗的烈性女子马小勤只求公道，决意用计揭露李经理色狼嘴脸。不曾想计划被同伙精豆出卖，李经理反设陷阱，马小勤下放己成定局。情痴武越又做出疯狂之举，为追随马小勤，欲在兴凯湖建立农科所。

　　武越和臭子对小勤的争夺战到达兴凯湖己趋白热化。性格狭隘的臭子屡因无端猜忌和恶言相向得罪小勤，在竞争中渐落下风。此后精豆策划逃跑，赶上罕见的五月暴风雪，小勤为保护姐妹们被冻僵，武越用身体暖回了小勤，冷酷的环境令两颗温暖的心贴的更近。

　　精豆趁虚而入，成了臭子的帮凶兼女友。不久，臭子发现将他所有工资骗到手的精豆太过功利，无法和小勤人品相比。他也知道小勤决不会吃头草，但他琢磨透了小勤仗义重情的秉性，于是利用武越回总部之机玩把阴招，抓捕逃犯负伤后装成疯子。精豆见状逃跑，小勤担当起护理责任，并将其送回北京治病。

　　回到北京后，那姑怀疑臭子装疯卖傻，要小勤返回农场，但臭子爹妈死活拽住小勤不放。想结婚冲喜为疯儿子治病。那姑不堪拿小勤当药引子的行径，怒骂臭子一家，令小勤速返兴凯湖。臭子爬上房顶借疯撒泼，制造丧命之险，臭子爹中风被抬进医院。一家三口，两个瘫子一个疯子，这家显然毁了。小勤只好咬牙答应了这桩婚事。她劝住死不松口的老妈，自己不是办喜事是做善事。等臭子父子病好了，将心换心，也该还她自由之身。婚礼人散曲终，臭子恢复正常，说装疯目的就是要把小勤娶到手，叫所有的人知道，我是你男人。

　　臭子用装疯将小勤框入新房却上不了手，小勤毅然返回兴凯湖，武越己被造反派隔离。小勤知道武越对自己仍然痴心不改，爱的如此纯粹，高贵，直令人心旌摇曳。为躲迫害俩人逃亡，用化名夫妻入住旅店。严酷的现实促成孤男寡女炽烈的结合。武越这才发现小勤还是处女之身，他幸福地说：我是你男人，你是我的幸福。

　　臭子商调被拒返回，发现武越和小勤己走到一起。怒火中烧，枪抵武越。不料被武越狠狠教训，声称再看见辱骂马小勤，会掐死臭子。自己的生命中只剩两件要亊，一是看护实验品种，二是不叫人欺负小勤。军代表为了保证高产试验不受影响，将武越秘密软禁工作，答应他任务完成后给他自由。