在《神奇动物在那里》第一部的结尾，纽特·斯卡曼德(埃迪·雷德梅恩 Eddie Redmayne 饰)协助美国魔法国会，将强大的黑巫师盖勒特·格林德沃(约翰尼·德普 Johnny Depp 饰)抓捕归案。

　　但格林德沃不久便兑现狂言成功越狱，并开始纠集信徒，着手实现他们的邪恶目的：让纯血统的巫师成为统治阶层，镇压一切非魔法生物。

　　为挫败格林德沃的阴谋，阿不思·邓布利多(裘德·洛 Jude Law 饰)向昔日的学生纽特·斯卡曼德寻求帮助。

　　纽特欣然允诺，却没有意识到，他将踏上的会是一段充满艰险的未来征途。

　　此时的魔法世界面临空前的分裂乱局，阶层鸿沟日益加深，爱与忠诚备受考验，至亲好友也可能反目成仇……

神奇动物在哪里2海报

　　故事发生在1927年，电影第一部结尾，纽特揭露黑巫师盖勒特·格林德沃(约翰尼·德普饰)真面目之后的几个月，舞台从纽约移到伦敦，然后再到巴黎。巫师世界越来越黑暗，逃亡中的格林德沃麾下招来了更多小喽啰，再次掀起风浪。能阻止他的可能就是他曾经最亲密的朋友阿不思·邓布利多(裘德·洛饰)，而邓布利多也需要他的学生纽特(埃迪·雷德梅恩饰)的帮助。最终邓布利多和纽特联手一起对付格林德沃 。