外科医生陈赫在为送到医院的一名身份不明的病患动手术，清除其脑肿瘤时意外地发现其脑内有胎儿的组织成分，并且听到一个怪异的呼唤“回去”，引起脑部剧烈疼痛。坚持完成手术后，他把取出来的胎儿组织成分放在办公室的试剂瓶中，在接到美娜的电话回家后，女友刘美娜提前为他过生日，两人玩的很开心。
第二天准备向美娜求婚的陈赫打电话约美娜，但她却去参加医疗志愿活动。志愿活动中美娜碰到两父子一起生活的孩子，其父亲在工地上脑部受伤，送到医院后，陈赫检查说没有希望，但美娜依然坚持要让其做手术，两人起了争执，美娜伤心地开车离去。在十字路口遭到车祸，陈赫惊呆。陈赫为美娜做手术，在手术快成功时却大出血，又一次令陈赫头疼声音再次出现。手术虽然成功，美娜却未清醒。
仁医分集剧情介绍(1-11集)大结局
之前不知名的脑瘤病患偷出医疗器材和试剂瓶跑出，手术结束后在天台休息的陈赫，碰到病患拿着东西，还边说要回去，两人争抢试剂瓶，不料陈赫跌下楼，穿越到1860年的朝鲜时代。
好不容易相信是穿越到朝鲜时代的陈赫，被捕盗厅当成劫匪，到处悬赏通缉。被李昰应搭救后，在市集上偶遇与现代的刘美娜一模一样的女性。
在躲避官府追缉时，遇到了因中枪需要急救的洪英莱的哥哥。
陈赫将英莱的哥哥洪英徽背回家，面对与美娜相貌相同的英莱，仍感震惊。
英莱恳求陈赫救自己的哥哥一命，在思想斗争后，陈赫决定实施朝鲜时代第一例开颅手术。手术过程波折不断，陈赫与英莱发生了激烈的冲突，好在最后顺利进行。由于之前英莱派人去官府举报，陈赫在手术之后，被官兵抓走。
洪英徽科举后并未出仕，佯装有病在家，实则是反对团体的领导人。景卓以为英徽是被盗贼所伤，来其家探望。
深感歉意的英莱和李昰应，为了解救陈赫多方奔走，但仍旧无果。
武官金景卓也发现出盗窃案的诸多疑点，但迫于左相金秉希的压力，维持对陈赫死刑的原判。就在刑场之上，英莱与手术后醒来的哥哥英徽及时赶到，与朝堂大人对质，再次为陈赫翻案。
陈赫即将被斩首时，左相突然晕倒，救父心切的金景卓允许陈赫实施手术。经过两次开颅后，终于找到了血肿块，救人有功的陈赫也免于一死。为了感谢之前的救命大恩，英徽邀请没有居所的陈赫到自家暂住。手术痊愈后的英徽来到据点与手下汇合，方知上次行动失败是由于捕盗厅故意散播出的假消息，诱其团伙上钩，他指示成员按兵不动，静待时机。
为了庆祝左相大人康复，受邀的陈赫与英莱前去道贺。陈赫受到了礼遇，但英莱却被众人奚落一番。景卓对伤心离去的英莱表明了自己的心意。花魁春红与苦恋自己的左相长子一同跳入河中，未将对方溺死，反而自己溺水。陈赫将她救起后，春红对医生的好感更加提升。
回家途中的陈赫与英莱遇到被快马踏伤的植儿母亲。英莱不顾性命将医用包取回，但手术前又遭到了植儿父亲的反对，争执中陈赫的手受伤，仍带伤坚持完成侧头动脉缝合手术。英莱对医用包发挥的功效感到神奇，陈赫在谈到治病救人时，不禁回想起美娜的种种，并追问英莱和未婚夫景卓的订婚原由。
回家途中，遇到一个严重腹泻的村民，欲将其救起的陈赫，看到英莱惊恐的神情，才知道是霍乱。
