林文馨相信困难是暂时的，她打定主意，一定和魏同甘苦、共患难，把事业做好，将来组建美好的家庭。她主动找到在后勤部打杂的魏明华，对其十分关心，但热脸贴了冷屁股，魏明华的态度却始终很冷淡，并与林文馨保持着一定距离。林文馨知道魏的心结，他不想再连累自己，于是再次找到魏明华，称自己愿意与他一起面对所有的困难，魏明华却说自己没资格接受林的感情，再次拒绝了林文馨的好意，林文馨茫然若失。
徐忠海和杨小欧的儿子百天，请林文馨、魏明华等人前来庆贺，魏明华却始终挥不去心头的乌云，没有勇气面对自己的过去特别林文馨真挚的感情。沈毅特别担心魏明华就此一蹶不振，警告魏明华慎重对待自己女儿的感情，希望他挺起胸脯、振作起来，魏明华苦笑着离开。
实验进入倒计时，林文馨被派往另外的基地参与实验。临行前，林文馨没忘记跟魏明华辞行，她拿着刚织完的毛衣送给魏明华，希望等自己回来的时候，魏明华能给自己一个明确的答案，魏明华却依旧对林文馨非常冷淡、视而不见。
要彻底终止一段感情，最好的方法无疑是移情别恋，与别人结婚。为了不再让林文馨受牵连，彻底断绝她和自己的感情，魏明华找到已回到基地恢复工作的童素云，很武断的提出想和童素云结婚。童素云很明白魏明华的想法，他这是在利用自己来忘却和林文馨的感情，她觉得自己成了垫背的，非常不满魏的草率。
在基地，带一定辐射剂量的金属球切割技术成了最大难题，切割危险系数高，难度大，每刀不超过头发丝的五分之一厚。找不到合适的人操刀，工作陷入困境。经过艰难抉择，徐忠海推荐自己的妻子杨小欧负责这项任务，因为她是跟随这台机器来到基地的，对机器最熟悉，她是最佳人选。可这个决定遭到杨小欧的强烈反对与抵触，她只有一条腿，还长时间没操刀了，最关键的是她有了孩子，心里压力很大。经过徐忠海的耐心开导，她认识到国家的任务大于个人和家庭，她必须担起这个重担，最终杨小欧不负众望，圆满的完成了这个任务。
林文馨的母亲看到杨小欧上台前留给孩子的遗书，百感交集、万分心痛，她也逐渐理解了这些年轻人到这儿来不是为了享受，他们是用激情和汗水实现自己的理想，完成祖国的大任。
沈毅安排完相关工作就回到原单位。林文馨在保密基地投入紧张的工作，她逐渐觉得身体出现异样，最终晕倒在岗位上。经医生检查，确认林文馨的这种症状是因长时间接触放射性物质而造成的白血球增多，病情十分严重。
魏明华也终于被正式恢复工作，即可动身前往林文馨所在的保密基地参加工作，到这里终于见到了朝思暮想的林文馨，他深情的告诉林文馨自己已恢复了工作，两人兴奋之余又谈到结婚报告的事，这个问题一直悬在两人心上。
虽然暂时恢复了魏明华的工作，但这是戴罪立功。基地领导专门找其谈话，重申林文馨是组织上重点培养的技术人员，希望魏彻底断绝跟她的恋爱关系以免耽误了林文馨的政治前途，魏明华别无他法，只能忍痛割爱。
误会必然接踵而至，魏明华开始故意躲避林文馨，林不明所以，对此十分苦恼与疑惑，两人的感情再度出现裂痕。林文馨回到原基地验收球体，却发现杨小欧亲自操刀的试验品出现了裂缝，因此向工作人员大发脾气。林文馨自己也感到自己情绪有点失控，她内心里其实知道原因：工作的压力太大，魏明华的琢磨不定、自己的身体状况。林母看到文馨状态不好，提醒林文馨注意身体，特别是告诫她要处理好与魏明华的关系，不要步自己的后尘，而林文馨希望妈妈赶紧和沈毅复婚。
杨小欧的母亲欢天喜地的来到基地看望孙子小胖，却意外发现孩子的异常。经医生诊断，孩子为先天性白内障，并且很快将会失明，杨小欧与徐忠海不敢接受这个事实，再次受到严重的打击，情绪陷入低谷。
魏明华听说了林文馨晕倒的消息，去医院调查才得知林文馨的病情已十分严重，内心无比焦急。而在基地这边，林文馨再次晕倒在工作岗位上，她意识到自己病情来的太快了，她想到还有未尽的事业，还有一直没有等到答案的恋人，还有自己未来得及尽孝心的父母，不禁心情十分沉重。但在母亲面前依然装作什么也没发生的样子，并劝母亲尽快与沈毅复婚，一家三人，终于能够其乐融融的吃了一顿团圆饭，其中的苦楚大家或许心里都明白。
医学院的书没有白读，当了医生的卓玛找到徐忠海，告诉他孩子的白内障有被治愈的希望，但也可能手术失败的可能性。徐忠海、杨小欧和杨母陷入了艰难的抉择。听到如果手术失败孩子永无复明的可能性，杨小欧不同意给孩子做手术，杨母却要带孩子去北京手术，并要徐忠海陪同。实验的最后关头，工作千头万绪，徐忠海的确走不开，这引起杨母的强烈不满，对老人来说，有什么还比孙子的健康更重要呢?
无论怎样，一定要治好孙子的眼睛。由于徐忠海夫妇都无法前去，杨母亲准备带自己的孙子去北京治疗，后来幸亏卓玛自告奋勇，主动愿意陪杨母去北京。
沈毅和林母终于有了点闲暇时光，两人时常散步、回忆起旧日的快乐时光。可好景不长，魏明华将林文馨的病情告诉了他们，几个人痛心不已，杨母怎么也不相信自己懂事的女儿这么快会离开自己，她不相信命运的安排。
好长时间以来误会和怀疑羁绊在两人中间，说不清、道不明，但其实都是为了对方考虑，眼下，有什么可以更好的方法能给林文馨带来安慰和快乐呢?魏明华向林母和沈毅提出当晚就要与林文馨结婚，不要任何的仪式，不要任何花哨的东西，他一定要给林文馨最后的幸福。
“你就是再活一天，也是当了我一辈子的老婆;你就是就活了一个小时，也是陪了我一辈子。”结婚当晚，他们彼此拥抱，珍惜当下的每一分，每一秒。
最后的实验马上就要开始了，关键时刻，魏明华的身份问题再次引起了上级领导的怀疑，上级领导找到沈毅，要求沈毅解除魏明华在明天实验中的主持人身份，由第二被选人林文馨来主持明天的实验。情况突变，大家陷入窘境，“我的命是共产党给的，我对党的忠诚，不容置疑，我只要求让我完成我的工作，做完我的试验，让我对国家和组织有个交代，让我不辜负多年来祖国和人民对我的培养。”经过战火洗礼的魏明华没有退缩，他用对党的坚决忠诚甚至不惜牺牲自己的生命来申请主持接下来实验，终于赢得了上级的信任和同意。
最后的时刻，实验出了问题，弹体未被引爆，如果出掩体检测，时间来不及，而且极度危险。万分紧急的时刻，魏明华挺身而出，接近弹体进行调试，弹体被成功引爆，魏明华没有来得及撤离，壮烈牺牲。
悲痛交加，林文馨病情危急，被送进医院。党中央十分重视林文馨的病情，要将林文馨送往北京进行治疗。临行前，林文馨要再去看一眼魏明华，父母二人推着她来到魏明华的墓前，林文馨凝视着墓碑，无限的哀思，久久的眷恋，回忆过往的点点滴滴，泪水再次模糊了她的双眼……
