丁紫玉将医院设计图拿给文三块，建议文三块开医院，文三块很感兴趣。丁紫玉建议文三块跟自己去国外考察医院，学习西方的先进技术，文三块不放心北京的病人，拒绝了，丁紫玉一个人出国考察。车站，王次长送别了身体痊愈的海东升出国留学。于世勋送古玩给王次长把玩，在王次长边上说了不少文三块的坏话，王次长对文三块异常看不顺眼。为了让菊花过上最幸福的生活，于世勋请了十几个佣人贴身伺候菊花，菊花很不适应。京城富商孙广才的儿子病了，文三块发现孩子患的是先天性心脏病，没有医治之法，除非换心，说者无意听者有心，孙广才决定不惜一切代价一定给孩子弄一颗心。文三块看好了房子，跟张宗翰商量好了，准备开医院。马金成的太太病了，肚子里长了几十条大虫子，张宗翰请来了文三块，一起会诊。文三块开出了毒药药方，将服用方法详细的告诉给了病人。马金成将信将疑，自作主张把药分成三份，病人吃死了。贾贵带着尸体来到三块堂闹事，事情闹得沸沸扬扬。于世勋得知此事之后，决定推波助澜，让文三块永无翻身之地，在于世勋的授意下，马金成把文三块告了。听说文三块有了麻烦，焦二爷变着法儿的想办法救文三块。
由于王次长从中作梗，文三块被抄家查办。文三块将成元等人交付给张宗翰，自己带上行李独自远行。听说文三块的事情，菊花心中担心，表面却还做出一副痛快的样子，和车母产生冲突，回到家后，车菊花痛哭发泄心中委屈，更加深了对丁紫玉的怨恨。文三块离家出走，焦二爷心中暗暗担心，派手下四处寻找文三块的下落。于世勋指使手下打晕了文三块，抢走了文三块最后的家当，文三块醒后只能和一群叫花子寄宿在破店之中。破店的掌柜的看文三块身无分文，并没有收取文三块住店的费用，文三块很感动，看到掌柜的有歪嘴的毛病，写了一个纸条，介绍掌柜去看病。听说文三块是一个大夫，一个叫花子求文三块给自己治疥疮，文三块教花子用铁锈治疗。歪嘴掌柜带着纸条来到张宗翰的诊所，大家这才知道文三块住在花子店里。成元和绿袖来探望文三块，请求文三块回去，文三块铁了心不受别人接济。听说文三块落魄了，富商孙广才很是高兴，这下文三块一定会收自己钱给孩子换心了!孙广才带了钱请文三块治病，被文三块拒绝了。焦二爷把上好家具送去花子店，被文三块原样退回，为了清净，文三块搬走了。菊花心中仍然挂念文三块，于世勋很是失落。文三块在街上摆了一个摊子，靠写家书谋生。绿袖用菊花给的钱替文三块租了一间房子，文三块总算安顿下来了。听说孙广才找文三块给儿子换心，于世勋顿觉这是跟文三块作对的好机会。
孙广才再次来找文三块，诊金加码到五千大洋，文三块不为所动，贾贵受于世勋指使来文三块的住处请孙广才，被成元看到，将此事告知文三块，文三块一切了然于胸。文三块在街上摆摊，受尽了冷眼耻辱，文三块一口闷气憋在心中。游方和尚再次遇到文三块，看到文三块不仅落魄，而且心中愤恨难平，交给文三块一张字条，希望能够让文三块平定心性，再成大业。孙广才再次来到文三块住处，以一万块大洋和三块堂的地契作为诊金，文三块终于答应了。于世勋听说文三块答应给孙公子换心，自己的计谋得逞，于世勋很是得意，就等文三块手术做完，当场逮捕文三块。文三块假意给孩子换心做手术，贾贵带了一队宪兵来逮捕他，他当面戳穿了于世勋的阴谋，贾贵悻悻的走了。文三块对孙广才表示自己手中有可以救他儿子的秘方，他不要钱，只要三块堂，孙广才从于世勋手里花了大价钱买下三块堂，文三块几番波折终于重回三块堂。丁紫玉国外归来，在丁紫玉的支持下，家业重新振兴了。丁紫玉的母亲去世，丁福天受到打击病倒了，绿袖细心照顾，二人产生感情。
文三块跟张宗翰定下了医院的名字——文翰庐，取文三块的姓，张宗翰的名，同时定下了成元和馨月的婚事，这双喜临门，两家都很是高兴。紫玉买了一辆自行车回来，带文三块来公园学自行车，刚巧撞倒了在公园玩耍的学谦，遇见菊花于世勋夫妇，于世勋借题发挥损了文三块几句，文三块很生气，态度强硬，引发了菊花的不满。文三块的医院开张，菊花看到文三块做的有声有色，心里很不是滋味，往日万般委屈涌上心头，对丁紫玉恨得牙根痒痒。菊花买了一瓶硫酸，准备报复丁紫玉。绿袖准备和丁福天去南京，临走和菊花辞行，刚好碰见菊花用硫酸在猪肉上做实验，心下明白大半。孙广才带着两个孩子来感谢文三块，文三块看到当初病怏怏的孩子活蹦乱跳很是欣慰。菊花来到医院门口，伺机向丁紫玉泼硫酸，被车母点了穴带走了。绿袖带菊花来到教堂，在教堂的钟声中，菊花感受到了异常的宁静，放下了心中的戾气。政府下令取缔中医，文三块决定去南京为中医请愿游行。学谦生病，久治不愈，菊花万般无奈来到三块堂请文三块为学谦诊病，刚巧碰上文三块准备出门去南京。文三块来到于家，于世勋很是不情愿，文三块不计前嫌治好了学谦的病，于世勋听从菊花的话跟文三块讲和，文三块没有接受，于世勋丢了大面子。日本大规模侵华，菊花女儿成琳担心于世勋当汉奸，菊花答应规劝于世勋。
北平警察重组，于世勋靠着给日本人送礼，仍然安稳的坐着警察局长的位置，菊花劝于世勋不要做局长，于世勋表示自己也不待见日本人，可是为了一家的生活自己也实在是无奈。张宗翰因为没有给日本人鞠躬行礼被日本人欺负，焦二爷路见不平把几个日本兵撂倒，却寡不敌众被群殴，高木司令听说自己一直拉拢的焦二爷被打了，赶紧叫吉野队长来道歉，焦二爷并没有买账。吉野提出要组建保安队的事情，焦二爷一口回绝，吉野想要对焦二爷不利，被于世勋拦了下来。日本人来没收中医院，遭到了大家的抵制，文三块被带到了高木面前，高木要求文三块为自己治病，文三块借着看病之名，狠狠地奚落了高木。高木并不在意，他提出要让文三块继续当医院的院长，文三块拒绝了。高木警告文三块，如果他不同意当院长，后果很危险。阎司令中了枪伤，连夜来到文三块住处，把他打鬼子的遭遇告诉给文三块，文三块安抚阎司令，安心养病。一清早，贾贵敲开了三块堂的门，催促文三块赶紧跟鬼子回话，并且要把文三块抓走，被赶来的焦二爷制止，悻悻而归。焦二爷和阎司令碰面，商量打鬼子大计，想要把北平的日本军官一网打尽，当晚，阎司令和文三块喝了酒，打鬼子去了，临行，文三块将祖传黑药赠予文三块。阎司令刚走，贾贵就以文三块叛变为由带走了，证据就是阎司令手上的黑药。在日本军营，文三块亲眼看到阎司令被处决，心痛不已。
