1531年，与教皇抗争失败后，亨利要求议会宣布他为英格兰教堂之首，以获得废除和凯瑟琳婚姻的权力，遭到了以莫尔为首的忠于罗马教廷者，极力抗击这一超前的异端之举。凯瑟琳因为亨利提出的教堂之首的议案，特意把托马斯叫来责备，指责他怂恿亨利做出如此危险之举。

经过投票，亨利的决议得到了多数票数，让他成功通过了议案成为英格兰教堂之首。托马斯为了救被抓的律师朋友詹姆士，以及为自己谋一个官职，特意去求安妮，想让安妮跟亨利求个情，安妮很轻易就答应了托马斯，让詹姆士公开认错就能获得自由。

安妮在谈完了公事之后，看到了托马斯手上的礼物，便好奇的追问了一下。托马斯说明，那是他准备送给安妮仆人简的礼物，安妮听了之后忍不住笑了起来，然后把简的父亲约翰与儿媳通奸被抓的事情说出来，说明现在托马斯送礼物有些不合时宜。

哈利向教堂提出申请婚姻无效，因为他与安妮有婚约在身，安妮为此非常烦恼，把托马斯找来想办法，想要证明她与哈利之间没有肌肤之亲。托马斯抓住了安妮想要登上后座的心理，借这个机会让安妮除掉亨利，以达到为沃尔西复仇的目的，所以他建议安妮是时候该摆脱亨利了。

托马斯去找躲起来的哈利，替安妮警告了哈利，说明亨利再敢说安妮爱他的话语，诺福克一定会将他剥皮剔骨，让他最好识相地收起他的那套言论。解决了哈利的事情，莫尔也被踢出局，安妮与亨利之间再无阻碍，而大法官变成了托马斯的朋友克兰默，托马斯的政坛之路看起来一片光明。

亨利领着安妮进入坎伯雷特大教堂之时，伊丽莎白以圣女的身份跑来，直指安妮是异教徒，如果亨利不除掉安妮坚持跟安妮大婚，那么他的统治期将只剩下七个月。诺福克他们不允许伊丽莎白散播谣言，直指伊丽莎白的所为将被送去妓院，然后将他们全部赶走。事后，托马斯去了加莱教堂，跟伊丽莎白要求，想听一下旧主沃尔西是否有什么遗言，而伊丽莎白则带着托马斯去见博金神父，想要遵从神父的意见。

与别国使臣外交的时候，安妮一直在角落里与外国国王亲密，亨利心里很是不高兴，托马斯看到了觉得那是个很愚蠢的举动，所以马上去提醒诺福克。诺福克看到安妮的举止，马上把她叫回了舞池，令安妮特别的不愉快。一切大功告成之际，玛丽想要私会托马斯，跟他好好消遣一番，没想到威廉会突然出现，托马斯差点将威廉当成行刺者杀死，让他也再没有兴致与玛丽消遣。

1533年，亨利和安妮正式在教堂举行婚礼，成为合法夫妻，随后安妮进行受洗戴上王冠仪式，真正成为王后。随后，安妮顺利怀孕了，而她在挺着大肚子之时，还不忘与凯瑟琳一伙争权夺势，担心自己的儿子即将出世，会惹来凯瑟琳他们的谋害。托马斯四处奔走，想要救出好友詹姆士，最终都没能成功，詹姆士还是被执行了火刑，让托马斯心里很郁闷。