传说黄帝战胜了残忍的蚩尤,但其八十一兄弟的元神藏于奇石之中。此石千年来吸收日月天地之精华,炼化而成赤魂石。赤魂石每24年活跃一次,得石者功力猛进,天下无敌,但必须清心寡欲,否则会失了心性,太清真人得到赤魂石后潜心修炼,自成蜀山剑派,为防后人为石所害,将其封存守护。明末,蜀山剑派诸葛驭我接任掌门一职,继续守护赤魂石,并迎娶师妹素因。在接任仪式上,师弟警我闯入,指责驭我抢走自己的所爱素因。他好不容易逃出伏魔谷,但左手已经变成烈火烧灼样。已经取得赤魂石的他突破蜀山重重障碍,痛下杀手,素因出现,拉住了警我,原来素因已经怀了警我的孩子。无我出谋攻击素因以抢回赤魂石,素因受伤,警我分心,驭我乘机将赤魂石吸入自己体内。为保护素因,警我活生生的挨了诸葛驭我一刀,脸上留下刀疤,怀抱着深深的怨恨,他带着素因双双坠崖。诸葛驭我虔心修炼,将派内事物交给无我处理,无我派人一直在寻找遗落的赤魂元神。在卧云村里,丁大力突然发病,神志不清,力大无穷,村民合力都无法阻止,妻子小玉出现,紧紧抱着大力,丁大力终于醒了,向村民们道歉。蜀山紫英和大师兄丹辰子奉命查找瘟疫的病因,查看了死去的村民,丹辰子感觉并不像是瘟疫,通过紫英养的叫小宝的老鼠,他们发现了一个女魔屠媚,原来瘟疫为烈影神宗绿袍尊者派人所为。青云和师兄张琪收到紫英消息,一同下山帮助紫英和丹辰子。遇到九毒神君,四人合力对抗。
卧云村名们一起放飞许愿灯,祈祷安康。发现了一个偷鸡贼,原来他是从瘟疫村里逃出来的小张,村民们不想收留他,大力却收留了他。