清康熙年间，郑亲王之女以丹格格未婚产子，在尼姑庵中产下双胞胎。不料尼姑庵被一群黑衣人包围，黑衣人在尼姑庵放起大火，以丹格格情急之下将怀中女婴交付婢女青儿带走，自己却仍然怀抱一名男婴被困火海。
青儿抱起女婴逃往，路上想起了以丹格格一年前在平南王尚可喜卸甲归田的当天，调皮的她大闹校场，连皇上都拿她没办法，没想到如今却落得如此下场。
事情发生在大约一年前的那天，平南王尚可喜卸甲的当天，皇上带着文武百官在校场为平南王尚可喜举行最后一次阅兵仪式，谁知尚可喜不慎从鼓楼跌落，皇上飞身救下尚可喜，以丹格格也女扮男装出现在校场。平南王卸甲后，以丹格格回到皇宫，皇太后为以丹格格准备了嫁衣和嫁妆，因为一个月后以丹格格就要嫁给两情相悦的烈亲王塔尔。皇太后赏赐给以丹格格一块玉章，上面刻了玉掌明珠几个字，皇太后解释说她喜欢以丹格格，就像掌上明珠般。以丹格格高兴的用印尼把这几个字印在了自己的手掌心，两人随即闲话家常喝起酒来。
皇上当晚大宴群臣，为平南王尚可喜饯行，平西王吴三桂气势逼人令皇上不悦却又不得不忍忍，皇上心中恼怒不免多喝几杯乃至宿醉。以丹格格和皇太后也因一时高兴贪杯喝至酒醉。
深宫谍影剧情介绍1-32集大结局
宫中的李贵人因为进宫以来一直没有得到皇上的宠幸而心有不甘，她找来太监总管安总管安排自己趁皇上酒醉之际侍寝，安总干拿了李贵人的好处自然替李贵人安排妥当。
当晚李贵人紫荷坐在轿中等候皇上归来，却因为内急一时离开轿子，而酒醉的以丹格格却误把紫荷的轿子当成了自己的坐了进去，几名太监抬了轿子来到皇上的寝宫，以丹格格不知到了哪里，见到床榻宽衣入内。皇上酒醉夜归，见床榻上有人等候侍寝，隧临幸了以丹格格，慌乱之际以丹格格掌心的印章痕迹印到了皇上手上。
以丹格格醒来发现自己竟然发生了如此荒唐的事情，羞愧难当急忙落荒而逃，却被赶来的紫荷和安总管发现，紫荷为了在后宫中立足，吩咐安总管不许外泄秘密，她代替以丹格格躺到了龙榻上。皇上醒来发现紫荷睡在身边，封了紫荷为宣妃，却不明白为何自己掌心有玉掌明珠的字样，却终究想不出昨晚到底发生了什么事情。
以丹格格回府后闭门谢客，烈亲王前来探视，却遭到以丹格格退婚。皇太后听说此事急忙叫皇上去询问发生什么事情，紫荷听说皇上要亲自过问此事，急忙找来安总管帮自己找了名男子破身，并狠心杀害男子和事发当日几名抬轿太监。
皇上来到郑亲王府，见到烈亲王站在王府门前不肯离去，皇上亲自到郑亲王府询问以丹格格，谁知以丹格格听说皇上亲临，无颜面见皇上偷偷溜了出去。整个郑亲王府全体出动去寻找以丹格格，烈亲王在大雨中找到了昏倒在地上的以丹哥哥，将她抱回王府。
烈亲王塔尔守在以丹格格床前，答应无论发生什么事情，他都要娶以丹格格为福晋，以丹格格听到烈亲王的发誓，却说出自己没有资格嫁给他。
以丹格格醒来烈亲王答应无论发生什么事情都要娶她为福晋，以丹紧紧的抱住了烈亲王。郑亲王为以丹格格请来大夫诊治，大夫却意外的说出以丹格格已经怀孕，郑亲王怒气冲冲的打算找人打掉以丹格格的胎儿，以丹格格听到郑亲王的话，急忙收拾了行李和婢女青儿一同逃走，到了城郊的尼姑庵里躲避。
十月后，以丹格格在尼姑庵里产下一对龙凤胎，尼姑庵忽然被一群黑衣人包围，他们放火烧了以丹格格的西厢房并残忍的杀害了众尼姑。危机之中以丹格格把女婴交给青儿带走，她却抱着男婴晕倒在火海中。
青儿抱着女婴跑到悬崖边，被黑衣人逼迫失足跌落悬崖，被农妇所救，青儿恳请农妇收养女婴，而她自己却终于熬不过摔伤痛苦死去，临终钱青儿拿出以丹格格留给女婴的玉印和玉蝴蝶作为日后认祖归宗的物证。
十八年柳含香在养母的养育下长大成人，成为一名出色的绣娘，去参加宫里绣女选拔，并且顺利的通过了第一关。回家的路上意外的和烈亲王家的三贝勒格泰撞倒一起，三贝勒格泰帮含香捡起掉到地上的绣花图样，两人结下了不解之缘。
格泰手拿荷包到处找人帮忙绣花，可是宫里都在准备评选绣女没有人帮忙，格泰 街上听说今天的绣魁会在含香和沈雪雁中产生， 格泰想到找沈雪雁帮忙绣荷包。
沈雪雁通过初试回到客栈被小儿告知贝勒爷在等她，沈雪雁见到格泰贝勒，格泰请求沈雪雁帮忙绣荷包，雪雁喜欢贝勒，连夜帮格泰绣好荷包，手指却被扎伤。
第二天的比赛，柳含香的百鸟朝凤引来了许多鸟儿因而柳含香获得绣魁，在接受安总管和海大人接见的时候，安总管不禁一惊，发现柳含香竟然长的酷似以丹格格，问起柳含香家事，柳含香回答在乡下长大，家中有父有母，安总管暂时放下了戒心。
柳含香和沈雪雁都被留在宫中，沈雪雁因为输给了柳含香而心中感觉失落。出宫后见格泰等在宫门口，以为格泰来找自己，谁知格泰却跑向柳含香，却被脚下的石头绊倒，抱住了柳含香，柳含香气恼的打了格泰一个耳光，转身离去，格泰急忙跟在柳含香身后追赶解释。
