唐太宗李世民年老病重，他的才人武媚娘随侍在侧，这天忽然甘露殿一角坍塌，掉下一本《宫廷秘史》的书籍，太宗要武媚娘拿来观看，太宗见上面写着：唐三世后，女主武王，代有天下。太宗看着武媚娘，立刻眼露杀机，媚娘却浑然不觉。
太子李治前来为父皇喂药，太宗命令李治一定要诛杀武媚娘，可是他不知李治早已和武媚娘产生恋情，他劝说父皇不可轻信歪理邪说，太宗告诉李治宁可信其有不可信其无，可是李治看到武媚娘依然无法伤害她。两人缠绵悱恻间，太宗驾崩。
太宗驾崩后太子李治继位，成为唐高宗。太宗出殡后，李治担心朝中大臣加害武媚娘，命令昭娘陪伴武媚娘，到感业寺出家，临行前高宗李治答应武媚娘一定会去寺中探望。
太平公主秘史分集剧情介绍1-45集大结局
一年后，当年的太子如今的皇上早已忘记了武媚娘。这天皇上来到感业寺上香，武媚娘听到这个消息急忙想办法去见皇上，皇上见到武媚娘立刻想起往日情缘。皇上在感业寺里宠幸了武媚娘，至此后经常来到感业寺和武媚娘相会。
一年后武媚娘在感业寺产下皇子，皇上听闻消息立刻赶到感业寺，并为皇儿取名李弘。武媚娘将李弘交给姐姐代为抚养照顾。武媚娘借机提醒皇上，皇上承诺一定带武媚娘母子回宫。
宫中的箫淑妃专宠受到皇后的妒忌，王皇后听说了皇上在感业寺里的武媚娘，决定以毒攻毒，接出武媚娘用以对付箫淑妃。王皇后派人接了武媚娘进宫，皇上龙颜大悦。
过了些时日，武媚娘再次怀孕，阴险毒辣的箫淑妃派人在武媚娘的食物里放了滑胎药，武媚娘只喝了一口就感觉出味道不对，她假装喝下整碗后肚子疼痛，说出有人要加害自己，请求回到感业寺去。皇上答应武媚娘的请求，并承诺在皇儿下生之前一定正式接武媚娘回宫，给她名分。
皇上在朝堂宣布武媚娘怀有龙种，一定要正式接武媚娘回宫，丞相长孙无忌立刻提出反对，理由是武媚娘是先皇的才人，如今正式回宫，实在于理不合。可是皇上心意已决，依然决定要接武媚娘回宫。
箫淑妃深夜造访长孙无忌，说起武媚娘的事情，长孙无忌答应会处理好这件事情。武媚娘进宫的前一天，带着李弘到集市上买东西，不料回来的路上遇到了刺杀。武媚娘身边却忽然出现了保护他的人，原来皇上早就派人暗中保护，武媚娘逃过一劫，暗下决心一定回到皇宫得到皇上恩宠。
第二天皇上亲自到感业寺接武媚娘进宫，可是箫淑妃和王皇后早已串通一气等在城门楼上，箫淑妃策动大臣们等在皇宫门口，不让武媚娘进宫。众大臣齐声高呼请皇上赐死武媚娘，武媚娘听到呼声走出銮舆，她说出她可以不进宫，可是肚子里的孩子和手上牵的儿子都是李氏子孙。武媚娘教授皇上亲自驾车闯入皇宫，众大臣不敢阻拦，武媚娘就这样被接入宫。
皇上加封武媚娘为昭仪娘娘，昭告天下。这天武媚娘再次临盆，箫淑妃找来法师诅咒武媚娘，武媚娘果然难产。箫淑妃买通了接生的御医，说出武媚娘难产请皇上决定选择大人还是孩子，武媚娘要皇上救皇儿，皇上迟迟不肯做出决定。
一旁的昭娘想起自己做接生婆的娘亲的方法，向皇上提出可以为武媚娘接生，皇上立刻命令昭娘为武媚娘接生，昭娘顺利的为武媚娘接生，武媚娘产下一女，皇上赐名太平公主。太平公主出生的时候手中握着一块玉，形状一头像龙，一头像凤，皇上看了心中高兴，太平的脚上也有同样的花纹。
箫淑妃和王皇后听说太平公主的龙凤玉的传说，箫淑妃提出要去感业寺抓几个人来审问，看看武媚娘生下的是不是野种。感业寺的众尼姑被抓，箫淑妃在宫中命人将他们严刑拷打。武媚娘听说这件事，立刻回想起自己在感业寺的时候受不住小和尚烤鸡的诱惑，让小和尚亲了自己。
其中一个经不住严刑拷打终于说出武媚娘在感业寺中时曾和白马寺的小和尚冯小宝通奸。箫淑妃急忙让尼姑画押，并把供词拿到王皇后那里，王皇后命令高侃去捉拿冯小宝，冯小宝却进山采药去了。
武媚娘听到消息急忙给感业寺的静缘师太写信求救。此事冯小宝已经逃出白马寺却被高侃带人围剿。冯小宝在师傅的帮助下冲出重围逃走，高侃只好找人冒名顶替，教唆他指认武媚娘。
这日皇上大宴群臣封小公主为太平公主，可是箫淑妃却首先提出送上礼物给武媚娘，礼物上来却是白马寺的小和尚，小和尚指认武媚娘，说出话她和自己通奸，皇上大怒，下令择日亲自审问。
皇上看着手中的玉石，忽然想起先帝的遗诏，他担心武媚娘真的由凤化龙，夺取大唐的江山。忽然天空闪电，太监来报甘露殿坍塌，皇上更加担心预言的真实性。皇上去了王皇后的寝宫，说出太平公主的事情，王皇后写信给长孙无忌，商议此事。
朝堂上褚遂良听从长孙无忌的指使说出公主身上的胎记乃不祥之兆，群臣大喊废黜武昭仪，赶出宫去，皇上犹豫不决，不肯下令。
皇后听说公主的事情决定亲自去看望公主，想到武媚娘的狐媚，她暗中嫉妒武媚娘几次怀孕产下龙子，在离开的时候故意关上窗户并用被子捂住公主的口鼻。
皇上最后终于下定决心拟昭废黜武昭仪，武媚娘听说后急忙赶到皇上面前哭着请求回到感业寺，皇上回想起自己和武媚娘的情缘，答应武媚娘带走李弘和公主回到感业寺。武媚娘哭着说出感谢皇上。
武媚娘回到自己宫中，发现公主昏死过去，她推开窗户急忙叫来御医和皇上，她发现公主经过开窗通气后醒转，为了加害王皇后，武媚娘亲手捂住了公主的口鼻。
昭娘取药回来，见到武媚娘加害公主，忍不住喊了出来，武媚娘急忙威胁昭娘因为失职害的公主炭火中毒。昭娘解释说出她临走的时候故意把窗户留了缝隙，武媚娘要昭娘记住是皇后要害死公主，昭娘是她的恩人，她不想这么早就失去昭娘。
太监去汇报皇上小公主夭折了，皇上听到这个消息立刻后悔自己糊涂误事。皇上移驾昭仪宫，审问宫女如何照顾公主。王皇后听说公主夭折立刻明白自己遭殃了。宫女们说出皇后来看过公主并关上了窗户，皇上认定皇后杀了公主，决心废了王皇后。
武媚娘失去公主后心中难过在昭仪宫中悬梁自尽，皇上听说后急忙赶到昭仪宫，武媚娘借机要皇上为自己和公主报仇。王皇后听说武媚娘真的以死博得皇上的同情心，心中暗自恨武媚娘的狠毒。
武媚娘向皇上说出公主夭折合了皇上的心意，如今公主夭折皇上只要赐死武媚娘就可以不用再担心武王的说法了。皇上见武媚娘难过急忙安慰，武媚娘曲解武王预言，并提醒皇上找来白马寺的弘一大师对那冯小宝验明正身。皇上果然相信武媚娘的话。
皇上找来弘一大师，弘一大师果然认出这个人不是白马寺的人，经过拷问，假和尚承认自己是赶车的，被高侃抓来诬陷武媚娘的。
昭娘想为夭折的公主最后洗洗身子，可是昭娘知道武媚娘是不会让公主活下来的，她决定偷偷将公主带出宫去抚养长大。昭娘把公主装进食盒里偷偷带出了宫外，武媚娘在伤心之余想再看一眼公主。（剧情百科原创剧情，转载请注明出处！）
