《天机录》引发数桩命案
王元丰因为破了安娘的案子名声大噪，来找他破案的人络绎不绝。很快，王家收入渐丰，他们赎回了王府大宅子，一家人终于搬了回去。这天，一个叫钟意的女孩找了过来，她让王元丰帮忙破姐姐钟思遇到的勒索案。
钟意告诉王元丰，姐姐钟思以前做过歌女，现在嫁给了陈员外的儿子陈坚。但不久前钟思突然收到勒索信，被人勒索银子，不然就把她做过歌女的事曝光。陈思不得不就范拿钱了事。没想到接二连三地遭到勒索，现在已经是第三次了。
王元丰去找冼风华一起。晚上，他们带着钟意拿着银子一起到约定交钱的地点，一间破旧的屋子。刚放好银子埋伏好，就见一个黑影一闪而过。等他们追过去，发现银子已不翼而飞，而房子里却什么痕迹也没有。就在王元丰纳闷时，咕叽突然对着一扇墙不停地发出声音。王元丰觉察出异常，他推了推墙，发现竟然是一扇活动门。
王元丰三人走进去，王元丰敏感地闻到一股檀香味。这时冼风华发现一本账本，他看到勒索人不仅勒索钟思，还勒索其他很多人。这时钟意一声尖叫，她发现了一具尸体。冼风华发现尸体还有体温，血迹还没有掩饰，他推测杀人的是个新手。根据尸体身上绣着红叶的衣服，他们猜测此人是红叶赌坊的人。
众人回到衙门不久，就查到死者身份，死者赵震是红叶赌坊的一名荷官。此时钟思过来反映了一个重要情况，她说自己过去沉迷赌博，为了筹在莫愁赌馆的赌资，她不惜去做歌女。但钟思后来越陷越深无钱支付，此时赌馆里兴起一项秘密生意，赌客们可以出卖自己的秘密或他人的秘密换取赌资。用来记载秘密的书籍就叫《无机录》。 后来莫愁赌馆倒闭，有了现在的红叶赌坊。 王元丰意识到，勒索案和赵震的死极有可能和《无机录》的书有关。
于是王元丰和冼风华乔装成赌客深入红叶赌坊。但赌完身上的前后却被人赶了出来。就在他们沮丧时，钟意告诉他们杀死赵震的人抓到了，竟然是陈坚。后来在审讯陈坚时，陈坚称，自己在钟思第二次被勒索时就发现了。他说自己在乎钟思，从来不计较她过去做歌女的事，所以为了钟思，前几天他在王元丰等人交银子时，躲在小屋里失手杀了赵震。
钟意的案子似乎是破了，但王元丰却觉得事情没那么简单。就在他和冼风华苦思冥想时，无意间听到衙役们说抓了几个老赌徒。两人顿时茅塞顿开。他们打扮成资深赌徒的样子再次混入赌坊。果然，在他们钱输光时，赌坊里的荷官主动提出让他们出卖秘密。
王元丰和冼风华被带到后院，有人逼他们喝下药水，然后蒙着他们的眼睛由人带着他们进入一个密道，然后让他们揭开蒙眼眼罩独自走到后面的房间。结果二人进入房间后发现并没有人，地上只躺了一具尸体，尸体赫然就是前些天在庞家大院卖人参的老庞。
冼风华观察到老庞已死去多日，而老庞身上便有一股檀香味。于是他们推测，老庞就是赵震的同伙，老庞负责抛头露面，而赵震才是幕后黑手。同样他们在房间里并没有找到《无机录》。就在他们诧异时，王给谏和钟意竟然带着人赶了过来。王给谏看到王元丰竟然还参与查案，他恼羞成怒愤然离开。钟意离开时走在最后，她无意间发现老庞身边竟然有一条腰带，她观察老庞的伤口，发现他是被人勒死的。
由于王给谏的干预，王元丰和冼风华被停止查案。这天王元丰和钟意走在街头，突然看到钟思脚步匆匆地提着药往回走。王元丰和钟思进到钟思刚刚抓药的药铺，在王元丰巧妙计策激将下，药店老板说出钟思买的药是专治跌打损伤的。钟意大怒，她这才知道姐夫陈坚竟然虐待姐姐钟思。
王元丰和钟意到县衙牢房设计支走看守佟强，然后他再次审问了陈坚。王元丰质问陈坚，像他这种殴打老婆的人是不可能不计较老婆做歌女的事，也不可能替老婆出头杀赵震。事实证明，陈坚在说谎。王元丰单刀直入地问陈坚，《无人录》究竟在哪里。陈坚不肯说，他说是如果那个人是不会放过自己的。王元丰还来不及问他究竟惧怕何人时，冼风华突然跑来告诉他们，陈坚家里起火了，他们一家人全部凶多吉少。王元丰和钟意拔腿就跑了出去。
王元丰和钟意看着陈坚家冲天浓烟，这时王元丰突然意识到中了调虎离山之计。等他们气喘吁吁跑回牢房时，只见陈坚倒在地上。陈坚看到他们用仅剩的一口气告诉他们三个字:蜘蛛人。说罢死绝身亡，王元丰听的不知何意。
太子府招护卫男女不限，艾丫为了试探冼风华真心自愿应聘到太子府当侍卫。她告诉冼风华，自己目的就是当太子妃。她就想逼迫冼风华向自己表白真心。
李煌厚为帮王元丰破案遇害身亡
王府里，王元丰和冼风华正讨论陈坚的案子。冼风华很不服气，他觉得陈坚临死前招供的蜘蛛并没有抓到，而王给谏并要求结案。王元丰突然想到任平生过去曾说王给谏诬陷他修造皇陵不力之事，他说王给谏和他背后的势力有更大的目的。王元丰怀疑王给谏有问题。这时，有衙役过来，交给王元丰一个盒子，称佟强失踪。王元丰打开盒子，看到一个沙漏和一张木甲制造图。他理解这是要他在规定时间里按图样造出木甲。
王元丰急忙开始动手制作。制作完成后木甲却突然爆炸。王元丰不解，细看图纸后，他发现少了个材料燧石，他觉得这是对方故意提示的地址。于是他们飞快赶去。果然找到佟强，他身上绑着炸药被捆在树上。王元丰解救了佟强。佟强称自己根本不知何人所为。
次日晨，王元丰再次收到一个木盒，盒子里仍然是一个沙漏和一副画。王元丰根据画的内容准确判断并找到被绑架的阿金。王元丰明白这是那个叫蜘蛛的人一贯伎俩，说一半藏一半。他决定要尽快找到蜘蛛。
冼风华为防不测，把衙役们都聚集在王家，让他们在蜘蛛抓到前尽量不要离开。王元丰这时想到解救佟强时在他身上找到的炸药，炸药没有杀伤力，更像戏班用来做舞台效果的。阿金也反映被绑架时听到过唱戏声。于是王元丰便锁定司徒琴音当琴师的那一家戏班。
等他们赶到戏班，只见戏班空无一人，钟意被吊在舞台中央。冼风华用飞镖刺断绳索，钟意落地前突然从舞台中央的地上升起许多刀剑，王元丰和冼风华来不及施救，眼睁睁看着钟意落在刀剑上被刀剑刺穿。王元丰伤心欲绝，跪在钟意面前愧疚地向她道歉。
这时，冼风华无意间看到舞台一旁挂着一张图。他拿给王元丰，图上有一句话，我们是天生一对终会见面但不是现在。看了图他们才知道中计，王元丰痛下决心，一定要抓住蜘蛛。他们去找戏班的文班主，但旅馆老板称他们已经搬走了。就在王元丰和冼风华失落间，他们突然在人群里看到文班主。他们抓住了他。
文班主当街被抓后对所犯罪行供认不讳。他承认自己就是蜘蛛。就在王元丰准备松口气时，文班主突然指证王元丰，称自己说做的一切都是王元丰指使的，目的就是他想捞取神探的名声。围观群众不明真相，纷纷指责王元丰用心险恶。第二天，甚至有群众围攻县衙，要求严惩王元丰。
王元丰处处受到质疑，但冼风华却一步步地陪他一起走过，他坚信王元丰不是那种人。
李煌厚不甘心王元丰受不白之冤。她跑到邬师爷房间翻看卷宗，这时她无意间看到一封带着臭味的信非常好奇。邬师爷告诉她，这是别人寄给陈坚的勒索信，但陈坚已死，信也没有用了。李煌厚发现信上有一枚鱼鳞，觉得此信对王元丰查案有用，于是她便拿走了信。
李煌厚想帮王元丰查案，于是她便去集市找鱼贩。这时雄哥追了上来，他从邬师爷那里得知李煌厚要查案的事，担心她有危险便陪着她一起。他们打听到鱼贩今天没有出生意去了销魂居。于是雄哥和李煌厚去了鱼贩家里，结果推开门看到一帮黑衣人正拿刀砍人。黑衣人见罪行败露，一起向雄哥和李煌厚扑了上去。
雄哥护着李煌厚边打边逃。无奈雄哥伤势过重，最后被黑衣人追上乱刀砍死。这时巡逻的衙役经过，黑衣人仓皇逃走，衙役们把伤势严重的李煌厚送回家，王元丰急忙抱住母亲。李煌厚用尽最后一点力气把一个小耳环放进王元丰手里，并告诉他，他的父亲还在人世，以后可以拿这个和他相认。李煌厚还想告诉他别的，但没有说完就断了气。王元丰伤心欲绝。
