一九四八年的上海，在军统一个秘密的审讯室里，一个名叫王三星的中共地下党员没有经受住严刑拷问，招认国民党军统内部长期潜伏着一个共产党的高级特工。这个消息惊动了国民党军统保密局处长唐栋，在唐的进一步逼问下，王三星又被迫招出，潜伏的共党特工身份大概是一名医生，并且，大概是名女医生——这个意志脆弱的落网分子，究竟是情急之下信口胡诌?还是确有其情?唐栋认为事不宜迟，必须马上展开调查。通过查阅军统医院的值班记录和在医院内安装窃听器、望远镜来进行直接监视，唐栋最终把怀疑目标锁定在两男一女三位主治医师身上——刘医生、翟医生和李赫男医生。李赫男共产党高级特工的身份在观众这儿从来就不是秘密。在那个年代，在那个特殊的工作岗位上，作为一个女人，她释放着超人的能量。谨慎的行动和缜密的思维，她沉着的应对查问并敏感的发觉自己已经被监视——她与生俱来的优雅女性魅力让监视她的唐栋竟然也有了瞬间的小恍惚，以至于这个瞬间足足缠绕了唐栋一生，且令唐心甘情愿为此纠结，直至纠结而死。此情后集详表。回到家中的李赫男看着窗外楼下监视的黑衣人，身心俱疲，关上灯，把自己抛入浴缸中，期盼着明天跟“他”的见面。“他”是李赫男的丈夫，也是李赫男的同事和上级，是中共上海地下党组织的领军人物，掩护身份是教堂的牧师胡云之。李赫男在告解室里向胡云之汇报了有叛徒出卖组织的情况，胡云之命令李赫男做好随时撤离的准备。共党组织经查证，揪出了王三星，胡云之决定与谭永源一起在小树林里处置叛变的同志。谭永源在讨饶声中把枪放在了跪着的王三星面前。
断刺分集剧情介绍1-32集大结局
王三星看着地上的枪，起身拔腿便逃，被谭永源两枪毙命。警察在小树林中找到了王三星的尸体，唐栋赶到现场，悄悄下达了一条口令，随后警察头目向在场的记者和群众宣布伤者即将被送往医院抢救。负责送走王三星妻儿的张文强被一张报纸绊住了脚，王妻看到报纸上正在被抢救的丈夫，无论如何也不愿离开了。唐栋吩咐下属冯丽娜派人封锁王三星病房所在的那一层，并考虑安排专门负责的医生。地下党组织对王三星还活着的消息匪夷所思并感到非常紧张，因为王三星活过来后定会疯狂报复，更多的党内机密会落入敌手，胡云之当即派谭永源去落实王三星生死消息的真伪。谭永源来到王三星所在的仁济医院寻找“二嫂”——医院药剂师龚承泽，了解到病房被封锁，各种药品不断往里面派送，的确是正在抢救的架势。不入虎穴焉得虎子?胡云之的方案是，让张文强假扮王三星的小舅子陪同王妻去医院“探望”王三星。正在家中收拾准备撤离的李赫男被突然到来的冯丽娜和一帮特务带走去执行一项保密局任务，冯丽娜没有给李赫男任何留下暗号的机会。当汽车开进仁济医院大门，李赫男才稍稍松一口气——好在是医院而不是监狱。原来，要和她一同执行这项任务的还有刘医生和翟医生。这时，唐栋出现，与李赫男握手并大方介绍了自己，说明需要他们完成的任务是24小时与外界完全隔离轮流监护一个病人。这个要被监护的病人就是已死的王三星。三位医师各怀心事，揣测着唐栋的用意。唐栋希望三位合力使这幅皮囊看上去像一个真正的大活人。李赫男提出需要特殊的防腐液，唐栋马上批准由冯丽娜陪同取药，本想创造和外界通风报信的时机也失败了。经过手术和外接设备的辅助，王三星 “重生计划”完成的令唐栋十分满意，作为奖励，在王三星病房隔壁，唐栋提供了一间麻将室，让大家娱乐放松。通过切磋，唐栋从牌品臆测总结出刘医生和翟医生一“财”一“色”的喜好取向，忠告他们当心因此惹祸。
王妻由“家属”陪同来探王三星，唐栋用一句“好戏就要开场了!”提醒大家进入各自的角色。李赫男斟酌现状，决定不能轻举妄动，因为就在病房墙上的一面单反镜子背后，唐栋正用他细密入微的洞悉能力观察着他们的一举一动。
李赫男如唐栋所愿的配合其他两位医生把这出戏演的很精彩，张文强没有收到任何讯号，也没有从王三星身上嗅出任何阴谋的气味。被蒙蔽的张文强把危险的错误信息带给了组织，胡云之为再度听到李赫男的消息而高兴——终于消除了他连日来对妻子安危的担心。同时他也意识到王三星的事情必须尽快处理，稍不留神后患无穷。于是他构架出了一套暗杀方案，布置准备实施。唐栋请李赫男三人吃饭喝酒，感谢大家的辛苦。问到何时结束任务，唐栋回答：“不出三天，必有好戏。”麻将桌上，李赫男在唐栋的教导下牌技渐精，唐栋的笑脸中流露出作为老师的得意和作为男人沦陷时的无奈。游戏散场时，唐栋邀李赫男一起喝咖啡，于是，李赫男第一次走进了唐栋的办公室，伴随着留声机里悠悠的舒伯特小夜曲，两人进行了唯一一次温暖的、令人心情愉快的、唐栋单方面十分动情的谈话，许下了“如果你不是共产党，我就娶了你;如果你是共产党，我一定亲手杀了你”的誓愿。办公室门外等待李赫男一个破绽就冲进去下手的冯丽娜，面对屋里融洽的谈话气氛，冯只能羡慕嫉妒恨。谭永源按计划混进仁济医院从天花板上到达王三星的病房。另一方面龚承泽正在为如何与李赫男取得联系而计划着。
李赫男接到配送的药品，发现药剂师错把青霉素配成了红霉素，她决心抓住这个机会。她端着药直奔唐栋办公室，不顾一旁冯丽娜的不屑，理直气壮的阐述：既然是演戏，就得演得真，演得好才行。如果我们的观众觉得戏不好看，提前退场了，那我们还演什么呢?独角戏吗?这个观点赢得了唐栋的赞赏。李赫男去换药了，唐栋立即命冯丽娜跟上。突然又意识到什么，慌忙起身也跟了出去。利用这个时间差，李赫男在冯丽娜尾随到来之前把消息传递出去，龚承泽清清楚楚的听到了那句“这是个圈套!”龚承泽佯装肚子痛才得以脱身离开医院，开始到处寻找胡云之。
胡云之这时正把儿子健生安顿在龚承泽家里，作为父亲，他做了最后的交代：在坏人面前一定要装作不认识爸爸。健生似懂非懂的点点头，看父亲离去。扮成清洁工的张文强安放好定时炸弹，从仁济医院大门里走了出来，向停在不远处的轿车示意，车里的胡云之收到讯号，下令开始行动。这时龚承泽横空出现，故意引逗埋伏在大门口的特务和他纠缠——这是在给胡云之中止行动的信号。可是还是晚了一步，一场惨烈的枪战过后，同志们都牺牲了，胡云之也身受重伤。躲在王三星病房天花板上的谭永源听到爆炸声，便按照事先的约定跳下来进行杀戮，当冯丽娜带着特务举枪冲进病房，这才看清了床上这个会骗人的死人，一切都晚了，谭永源毅然把枪口抵在了自己的胸膛上。
隔壁麻将桌上的人早已被外界的爆炸声折腾的安奈不住了，当最后一声枪响传来时，唐栋一直得意带笑的脸阴沉下来。邱受德跟踪张文强找到了龚家，厮杀后，只把孩子们带了回来。李赫男在是否抢救谭永源的问题上还是挣扎了一下，因为她不敢想象活下来的谭将要面对什么，但眼睁睁看着战友死去，她做不到，救人，这是本能。放李赫男回家后，唐栋从龚家的孩子们中挑出了不一样的健生。胡云之也被成功救活，在审讯室里，唐栋亲自跟他聊起了信仰和人生。
唐栋以一副儒雅极具涵养的面貌提审胡云之，谦逊的像一个充满好奇心的学者，胡云之对这暗藏的不怀好意只报之以沉着的冷漠。唐最终让健生登场，哭泣的孩子差一点就动摇了他坚定的意志。好在听话的健生依照胡云之之前的吩咐，没有与面前的爸爸相认。刑讯终于让胡云之有了生命危险，唐栋考虑医生的人选，派冯丽娜去请李赫男。
李赫男看着遍体鳞伤的胡云之，忍着震惊和无比的心痛为他打针上药，微微苏醒的胡云之暗示李赫男给他毒药。李赫男将怒气控制在一个不至于被怀疑的程度上去找唐栋说理。她以良心和人性为主题斥责唐栋对于一个普通牧师的残忍，唐栋只回应给她一副无动于衷的表情，坦然说明自己理所应当接受报应。冯丽娜向毛人凤告状说唐栋对李赫男藏有私心，因为证据不足捕风捉影而被毛训斥。李赫男欣喜的发现了组织的联络暗号，她摆脱重重跟踪，找到了等待她的方时中，了解情况后，方时中建议满足胡云之的意愿，给他毒药结束痛苦。李赫男绝望的准备毒药氰化钾，并从唐栋那里得到给胡换药的批准。可最终还是没有狠下心把毒药留给胡云之。冯丽娜对李赫男和胡云之的关系有所猜测，但没有从胡那里搜到什么，她领着健生想进一步试探李赫男，也没有得到她所期待的反应，最后在没得到唐栋首肯的情况下佯装掌握了证据，逮捕了李赫男。李赫男被捕的消息通过摩斯密码传给了大牢里的胡云之。
