洪立赶到扇子店询问赵婶和怜花是否得罪过和珅，赵婶想起了前两天买扇子的人。洪立遇见了为灾民筹款而受伤晕倒的七爷，他在怜花的指导下救了七爷，并与怜花结为兄妹。
洪立与怜花从七爷那里得知瘟疫闹得很厉害，他们决定到山上采药医治受灾的百姓，结果遇到了和珅，和珅将洪立与怜花出游的事情秉明了皇上，皇上召见洪立，洪立说怜花姑娘不懂医术。
皇上知道洪立在撒谎，于是吩咐和珅从京城把太医都叫来。七爷的仇人来扇子店闹事，洪立连蒙带骗将那伙人赶走了。洪立拜怜花为师，洪立与怜花非常谈得来。
江北地区的瘟疫越来越厉害，洪立和怜花准备去那边治病救人，但是医药费还是不够，洪立从家里偷偷拿走了一部分钱。
皇上派人盗取怜花姑娘的一把黑扇子，看是否是过去一个太医的，没成想怜花刚巧把扇子拿走了，放了一把普通的扇子在盒里，皇上看到扇子并不是黑色的水月莲花扇，于是再没有继续追查。
皇上对怜花产生了好感，并以金爷的身份来到了扇子店，正赶上一帮人来扇子店闹事，皇上驱走了闹事的人，在怜花姑娘面前争得了面子，压过了洪立。
和珅向皇上报告了南方闹瘟疫的情况，并把皇上请到了扇子店斜对面的一个药店里，这个药店是和珅专门为方便皇上与怜花交往而盘下来的，和珅向皇上说了为赈济灾区选拔优秀医生而举行医方擂台的想法，皇帝同意了。
洪立收到了医方擂台的请帖，皇上也推荐由怜花出面做擂台总裁决。为了让洪立远离怜花，和珅把洪立与怜花在一起的实情告诉了大梅。
洪立和怜花为了灾区的疫情和躲避和珅决定离开扬州前往灾区治病救人，由于病人太多，洪立和怜花的药都用完了，怜花姑娘也由于过度劳累病倒了，为了能够有更多的药救济灾民，洪立和怜花准备回到扬州参加朝廷举办的医方擂台。
擂台如期举行，对垒双方分别是太医院和洪立，裁判是怜花姑娘。洪立的药方因为结合了受灾病人众多的实际情况而胜过了华而不实药材成本过高的太医院一方，夺得了擂台的冠军，在暗中观战的皇上也觉得洪立应当胜出。
大梅看到怜花通情达理，在心里也慢慢接受了怜花姑娘。怜花见洪立人品医德都不错，决定收洪立为黑扇神医门下之徒，而黑扇神医的门归要求加入医门的外姓人必须娶怜花姑娘为妻，洪立应允了下来。和珅告诉大梅洪立要娶怜花姑娘，本以为大梅能大闹一场，没想到大梅并不生气。
