一个卖光盘的外地妇女的孩子患了流行性脑膜炎，而这个孩子又将病毒传给了城里所谓富人的孩子，面对着大量外地务工人员拥进我们这个城市，而他们又游离在正常的防疫系统之外，使得CDC面临着从来没有过的困惑。
接近退休的乡级防疫人员老莫干了一辈子卫生防疫工作，他总是对民工、保姆等外来务工人员的卫生防疫十分关注，由于他的执着，帮助CDC小组找到了脑膜炎传播的病源，同时也使得CDC加强了外来务工人员的卫生防疫工作。
陈思源在练习居合道的健身俱乐部结识了年轻漂亮的健身教练徐洋，并深深为徐洋充满活力和独特的个性所吸引，却在某山区调查不明原因的神经炎症症状的疫情时，惊讶地发现山区患者身上的红斑跟金子身上的一模一样。
疾病被确诊为被昆虫蜱叮咬后导致的莱姆病，而金子身上检到的病原体与疫源地证实是同一传染源，但徐洋却否认去过该山区。陈思源等正探询为什么会在远离疫源地的大城市单独出现这一例病例时，无意中又在该俱乐部老总罗刚身上发现了同样的红斑。
但罗刚也否认去过疫源地。在CDC科学缜密、锲而不舍的追寻下，终于查明了这两起城市病例的疫情真相，并无意中获知了徐洋与罗刚以及一个大龄富婆之间令人慨叹的情感事件，令人感叹现代人在对大自然和情感世界的探险时都会带来许多始料不及的新冲击。
警方抓获的两名外籍入境毒贩感染我国从未出现过的烈性传染病：马尔堡病毒病。世卫组织专家Lutz和助手Peter前来协助CDC工作。经查，毒贩入境后一直呆在屋里，被捕前只跟快餐店送餐员接触。CDC找到送餐员予以隔离，并追查送餐员接触的人群。
年轻的富家女孩小炎从小父母离异，享受不到人和人之间正常感情和温暖的她不停地以婚前体检为名目，约跟她好过的不同男人来CDC验血查艾滋病，给忙碌的CDC带来不少干扰。送餐员接触过的酒吧调酒师强子发病，确诊马尔堡。
在追踪强子接触人群的过程中，CDC来到了小炎家。原来强子不久前参加过小炎家举行的party，并无意中跟小炎共用过同一只润唇膏。
小炎坚决不接受CDC必须对她进行的全面体检，已怀孕两个月的她现在想要的就是一个健康的孩子，一个纯洁的生命来填满她内心的孤独和空虚，最终在陈思源、林涵等的劝导下小炎重获积极健康的生命信心，而此次跟世卫组织合作的经验也使CDC也成功地完成了“新发传染病防治技术研究与应用”的课题。
