“文革”开始后，先后有一大批老一辈革命家被打倒，陈云也不例外，但所有不公正的待遇陈云都默默承受了。
陈云在这段时间里关心几个子女的工作问题，鼓励孩子们要到艰苦的地方去，保持艰苦朴素的作风，遵守当地的规矩和纪律。
女儿陈伟兰毕业分配想留在成都，希望父亲帮忙，但陈云坚持原则，没有管这件事，并做通了女儿的思想工作。1969年，陈云只被保留了中央委员，他利用这段时间看书和思考问题，做些调研。
中央通知陈云到江西南昌，陈云住进青云谱干休所，化名陈元方，在江西机械化工厂调查研究。与此同时，陈云的大女儿陈伟力在湖北五七干校遇到了已经被打为反革命分子的母亲于若木。
陈云给江西省委书记程世清写了一封信，要求了解些情况。负责接待陈云的人逐渐被陈云的人品所折服。
1971年秋，陈伟力从湖北到南昌看望父亲，陈伟力没敢把母亲被打倒的事情告诉陈云。
随后，陈伟兰从西藏复员回来，到江西看望父亲，陈云很高兴。
陈云的大儿子陈元要结婚，到江西办婚礼，陈云很高兴，他告诫子女“不唯上，不唯书，只唯实，交换，比较，反复”。
陈云让孩子们有时间去看看母亲，还鼓励孩子们要多读书，多学习。
1972年，陈云和孩子们回到北京，在陈云的努力下，于若木也与家人团聚。
陈云通过华润银行了解到目前国际货币市场的情况，断定黄金会一直涨，手里有大量的外汇，可以考虑买进黄金。
在陈云的指示下，我国黄金储备很快翻了一倍，这批黄金不仅在后来的美元狂跌中保证了外汇的稳定，还为后来的改革开放奠定了基础。
1976年，毛主席和周总理逝世，中国向何处去，老一辈革命家为此都忧心忡忡。
“四人帮”被粉碎后，陈云开始考虑下一步的工作，建议在时机成熟的时候召开十届三中全会，并要求调查天安门事件的真相。
1978年，十一届三中全会召开，陈云当选国家副主席和中纪委书记，开始展开为冤假错案平反的工作。
刘少奇之子刘源来见陈云，感谢陈云为刘少奇平反并放出了王光美。中央要成立财经委员会，陈云当主任，第一件要处理的事就是上海宝钢工程。
陈云提出要求，一定要把宝钢搞好，可以把建设周期拉长一些。由于工作繁忙，陈云再次病倒，并被诊断出患有结肠癌。
