唐僧与沙僧、莲花等进入冥界，救出佛界众圣。碧游的魂魄飘荡到不周山，共工为她恢复了元神，让她身形重现。悟空与八戒、哪吒等终将十六颗舍利子找齐，却被无天的元神黑莲所俘，悟空等人设计逃出，无天乃调兵遣将直扑东华山，对舍利子志在必得。
无天包围东华山，与悟空等人激战，无天要求悟空与他单独决战，为了保障东华山众人平安无事，悟空答应，战前镇元大仙将十六颗舍利子交悟空一口吞下，悟空战败，只身随无天及众妖而去，唐僧、八戒等忧心忡忡。
悟空被无天置入黑暗之渊的沸鼎中，以烈火锻炼，意欲炼出舍利子。唐僧师徒异常焦急，派出能抵御弱水剧毒的八戒前去营救。悟空在烈火中久经炙烤，开始化出舍利子。
八戒冒死趟过弱水，潜入黑暗之渊，乘看守的妖魔不备，掀开沸鼎，救出悟空，夺回舍利子。唐僧与镇元子、哪吒一道，艰难地踏上迷幻险恶的“七伤路”，直奔阿修罗界，解救关押在那里的天庭诸神。
悟空与早已暗中制造无天的阿依那伐经过反复较量，终于进入阿修罗界，解救出天庭众神，并得到无天善念化身白衣无天的及时帮助，打开被阿依那伐关闭的神秘机关铁门，一同向关押灵儿的灵霄殿进军。
悟空、唐僧、沙僧、猪八戒、小白龙、哪吒、镇元子与莲花、碧游一齐出动，与魔头无天的兵将展开激战，久久难决胜负，悟空此时得知自己就是制服无天的西游记后传第十七颗舍利—无骨舍利，于是毅然跳入火海，化作一颗巨大的舍利子向无天击去，无天终于消亡，三界归于平静，如来重归佛界。众人齐心协力凝聚意念，悟空奇迹般地回到了三界之中，如来佛祖封孙悟空为新的万佛之祖——南无大圣舍利尊王佛，自己则成为古佛，悟空打坐莲台，安详如仪。
