白莲花从五真手里把灵儿救了下来，并且杀了了灵儿。白莲花向灵儿诉说着自己对他的感情，并表示石敢当不是好人，让灵儿提防。但是灵儿和碧游都认为石敢当十分磊落，是白莲花的师傅出了问题。白莲花偷偷给青羊道姑报信说，石敢当的爪牙要将灵儿带到蓬莱，让青羊道姑尽快赶来。
奎刚的各路妖怪都在赶往陈官镇，石敢当一众人也在赶往陈官镇的路上。灵儿和白莲花各执己见，打了起来。知道巨蝎等人到了，白莲花才知道自己上当了，自己出卖了灵儿。灵儿担心伤及无辜百姓，答应跟巨蝎等妖怪走。
奎刚盖住了灵儿的天灵，想以弱水之毒制成的四十九朵金莲杀死法身。没想到这时候护体神光再次出现，而且无论如何也伤不到灵儿。原来玉帝一直在守护着灵儿。奎刚这才明白自己的法力与玉帝是相同的。如果没有七颗万法之宗的金丹，是无法煅杀其法身的。
石敢当一行人经过商量，决定杨戬、白莲花、碧流等人赶到冥界将众神救出。石敢当与朱半斤和娜扎去寻剩下的四颗金丹。
石敢当等人到太上老君兜率宫寻找金丹地图。几人不小心触碰了机关。石敢当前去寻找控制机关之所，朱半斤和哪吒则藏在兜率宫。石敢当化成赢妖的模样，按下所有的机关按钮。然后石敢当领着朱半斤和哪吒向通往太少老君道场的楼梯走去。
在太上老君的道场里，石敢当找到了一个刻着“欲求金丹，请到五庄。劫数来时，托与镇元”字样的六孔匣子。然后盒子便消失了，只留下一块黄绢。
这时赢妖已带领数百灵兵站在门前，而石敢当身边的朱半斤和哪吒原来是黑袍护法和巨蝎精幻化成的。石敢当百变身形和三怪对抗，在即将逃走之际，奎刚出现了。石敢当实力不及奎刚，掉入裂缝中。裂缝底是一个山洞，哪吒和朱半斤也被抓到了那里。石敢当一直手拿一根金线，他拽着金线，纵身一跃从地下飞了上来，身后朱半斤和哪吒也都破土而出。然后兜率宫内所有的机关都启动了。
赢妖身变成了一个巨大的葫芦和石敢当激战起来，被石敢当从脏腑内击破，丧失了真神。
老君西去之前，将金丹的秘密告诉了镇元大仙。石敢当一众人飞速地赶往镇元大仙的道场，
王母娘娘借举办丹元大会共同商定名册的由头，将镇元大仙邀请到瑶池。没想镇元大仙走后，他的道场五庄观变成了修罗场。天地宝鉴照出了妖怪元身，道士们倒在众妖的刀剑之下。
石敢当等人来到五庄观后看到的就是这样犹如修罗场的场景。石敢当借助天地宝鉴，了解到了事实经过。宝鉴知道石敢当等人去救镇元，因此缓缓合起变得其小如钱，落在了石敢当的手中。
王母娘娘逼镇远说出金丹下落，镇远不从。王母娘娘变回了乌鸦怪原型，并逼镇远服用了百转丹。
四海龙王率海龙兵将落伽山团团围住，灵兵们措手不及，被精锐的海龙兵杀的尸横遍野。而乌鸦大王和黑袍则随船渐渐潜入了海中。
黑鸦大王变成石敢当的样子，向镇元套出了七颗金丹的下落。
黑鸦和黑袍来到斗牛宫中，人直奔斗牛宫顶的莲斗之处，果然有一颗金丹。有一颗金丹藏在蒙界之中。而如果穿越冥界进入蒙界太费时间，黑鸦和黑袍二人赶到天庭圣境兜率宫，通过乾坤地理图的来到蒙界，并从万宗塔中顺利取得了金丹。
这时黑鸦亮出了真相，原来黑鸦是由石敢当幻化所成。而手上沾满了无故人鲜血的黑袍则被蒙界的冤魂们围攻上，黑袍发出一声声凄厉地惨叫。
乾坤地理图一旦合上，里面的人便无法出来。在乾坤地理图即将合上的千钧一发之际，石敢当和哪吒跳了出来。面对敌方的攻击，镇元救下了他们。石敢当、哪吒、朱半斤、镇元四人往蓬莱飞去。
此时离玉帝回来的三十三年之期只有六天了。只要石敢当等人在第六天子时之前，无法将金丹的神光注入到玉帝的法身体内，那么，玉帝就不能回来，奎刚就还有三十三年的时间。
杨戬、白莲花、敖申和碧游试图从轮回隧道进入冥界，救出被俘的天神。碧游无法通过正反旋风，为了不连累大家主动选择了牺牲。
乌云早已埋伏在轮回隧道进口大门处。趁乌云不注意之时，杨戬三人飞速出来，并幻化成灵兵将乌云送进了轮回隧道之中。
碧游的魂魄和灵儿告别后来到了不周山，遇到了共工，共工给碧游的魂魄重造了身体，并将毕生功力传给了碧游。只是碧游的身体是由桃木制成，万不能见火。
