蒋介石来见毛泽东，对两党合作讲的头头是道，并邀请毛泽东去黄埔军校讲课。毛泽东欣然答应，来到黄埔军校中授课，痛批破坏国共合作的种种行径，令蒋介石颇感难堪。另一方面，别有用心的蒋介石也利用毛泽东讲课的机会，开始悄悄调查军校学生中到底有多少共党成员。然而毛泽东的一番激昂的演讲不光打动了黄埔军校的师生将领，连张静江都对他十分钦佩。蒋介石继续扩张自己的势力，东征陈炯明，彭湃的农民武装发挥了巨大作用。毛泽东有感而发写出《中国社会各阶级分析》，深刻的分析了国内革命的目前局势。周恩来等人察觉到蒋介石的狼子野心，商议将共产党员从蒋介石的军队中完全撤出，但遭到了陈独秀的反对。国民党二大召开，国共矛盾进一步激化，陈独秀各退一步的提议并没有缓和两党之间的矛盾，反而进一步削弱了共产党在国民党中的话语权。
汪精卫要派蒋介石到西安执教冯玉祥的部队，遭到蒋介石当面回绝。蒋介石厉兵秣马，终于在李之龙中山舰事件的诱发下，开始密谋对共党和汪精卫采取了措施。蒋介石连夜出击，以捉拿刺客为由变相软禁了汪精卫，同时开始大规模的清查共产党员，将一军和黄埔所有的共产党员全部扣押。周恩来前去质问无功而返，反而险些被软禁。毛泽东一边利用宣传部的工作便利予以舆论反攻，一边设法营救被困的革命同志。宋庆龄和何香凝两位夫人也积极出面营救。
蒋介石不得已做了让步。陈独秀失踪，毛泽东等人商量联合国民党左派共同讨蒋，却奈何广州区委无法做出如此重大的决定。毛泽东决定找到苏联代表季山嘉，一同商讨对抗蒋介石的对策，然而季山嘉也同样并不敢拍板同意毛泽东的请求，仍一味坚持按照苏联的既定方针，继续国共合作。汪精卫四处求援不成，决定装病在家，在等待机会东山再起。蒋介石虽然忌惮中共，但是又受到各方舆论的压力，深感此次行动太过急于求成，反而有贪心不足蛇吞象的危险。为了自留后路，蒋介石只得释放扣押的共产党员，同时向毛泽东递交了一份自请处分的书信，企图将一切罪责以误会为由一笔带过，遭到毛泽东的讥讽。
许多党员对蒋介石的深恶痛绝，要求一致讨蒋。陈延年到上海找到陈独秀，一再陈述团结讨蒋的必要，陈独秀却依然一副家长态度，为保民主革命进程，坚持拉拢蒋介石的战略，父子二人彻底闹翻。蒋介石“对人不对俄”的表面说辞，获得了苏联方面的谅解，遂开除了黄埔军校暴露身份的所有中共党员。此刻的中共更感自己力量单薄，开始计划建立广州军委，周恩来前往担任书记。汪精卫眼见蒋介石势起，准备逃往法国。正在蒋介石筹划将毛泽东等人继续清除出国民党高层之时，胡汉民回到国内专程来找蒋介石。胡汉民代表国民党左派支持蒋介石反共，企图借此机会重回国内，早已经一支独大的蒋介石哪里需要这样的支持，反而鄙视的下了逐客令。蒋介石假惺惺的欲推举张静江为新主席，对蒋介石了如指掌的张静江推辞不受。
蒋介石提出《整理党务案》，以不可跨党的方式欲将共产党的势力清除出国民党。中共方面只有毛泽东一人坚决反对。无奈势单力孤，孤掌难鸣。在《整理党务案》的阴影之下，大批共产党员只得退出国民党，毛泽东亦离开了国民党宣传部。毛泽东来到农讲所，开始全心投入农讲所的工作。蒋介石到农讲所旁听毛泽东的课，被毛泽东当众点名提问，一番不容回避的质问，令他下不来台。虽然受到蒋介石的不公平待遇，由周恩来、聂荣臻和黄锦辉三人组成的广东区委军委依然联合叶挺独立团积极筹划协助北伐的工作。朱德、邓小平等也为支援北伐回到国内。陈独秀指示朱德暂时不要公开自己的党员身份，借机策反四川军阀杨森，同时接近蒋介石。
邓小平被派到西北劝冯玉祥处，协助成立黄埔二期的工作。毛泽东带着农讲所师生到彭湃处实习，动员他们响应革命，并且在田间地头为他们举行了结业典礼。在国共双方的共同努力下，北伐战争高奏凯歌，共产党员们立下了赫赫战功。毛泽东却与陈独秀为了农运问题发生争论。毛泽东到湘赣考察农民运动，受到当地农民的欢迎，启发良多，却不知一直视他为眼中钉的军企图除他而后快。在当地农民的帮助下，毛泽东从军阀的追捕中安然涉险。
