金深水拒绝了，但林婴婴却非常激动地说了一番话：“你忘了你死在日本人屠刀下的家人了?你难到就忍心看在前线浴血奋战的同胞们，因为缺医少药而白白牺牲么?你真的想让我们成为亡国奴?!想让之前的那些同胞，亲人们都白白死掉，不管你怎么看我的组织。你应该知道，现在是团结一切可能团结的力量对抗日本侵略者的时候，请你想一想。”
金深水彻夜难眠。妻女的惨状、日本鬼子的狞笑，上级兼师长革老的厉色，林婴婴的激动都让他左右为难。第二天金深水对林婴婴说："请你带我去见你的上级。"
金深水随着林婴婴见到了高宽。金深水答应把这批药品卖给了高宽。但高宽告诉他，他们上次买这批药材的钱也是好不容易凑到的，现在已经没钱了，希望金深水帮忙帮到底。金深水决意为抗日前线的战士们出一份力。
受辱的静子找金深水诉苦。他告诉金深水，天皇幼儿园最近来了一个人之后，一切都变了。但这个人在日本科学界，是赫赫有名的科学家，现在，就连中村将军也要听他的。虽然金深水很想了解更多，但静子欲言又止。
在林婴婴的指点下，金深水找到倒卖西药的黑市商人。他以保安局的名义，讹诈了八根金条。他把这八根金条全部孝敬给了卢局长。
金深水以把药品拉到上海出售更安全为由，从卢局长那里拿到了通行证。金深水拿着批文亲自去仓库把药品提走。但是被秦时光盯上了。
金深水协助高宽顺利把药品运出城后返回保安局。高宽把药品运到江边，开始把药品往渔船上搬。秦时光带人悄悄摸上来，进行抓捕。双方展开一场混战，渔船安全离去，但高宽受重伤，秦时光也受伤。
听到枪声后，金深水和卢局长一起赶往城外江边。江边草丛里躺着几句保安局特务尸体，还是受伤呻吟的秦时光。他斥责卢局长私吞公物，扬言要到野夫那里告状。卢局长一枪打死了秦时光。保安局其他人赶到后，卢局长说："秦时光勾结黑帮、侵吞公物，被我正法了!"
腾村让小野把幼儿园里三十六个孩子分成六组，先将AB组隔离进行实验，A组实验病毒，B组实验疫苗，每半个月做一次常规智力测试;每三个月有腾村亲自来负责做一次深度智力测试。
腾村认为，虽然密字黑药的研制只用了三个月，但是，白药的研制估计需要三年时间。因为这是一种复杂而神奇的病毒，需要时间来考测、证明。
腾村认为，秘药白号最神奇也是最难攻克的地方就是，它要在不摧毁人类智力的前提下，剥夺人类的自我。既要使人像蝼蚁一般，绝对地服从命令，没有反抗意识，没有任何的欲望，爱憎，喜怒。同时又不会变成完全没有思考能力的废物。当然，所谓的思考仅仅是思考统治者所要求他思考的东西。只有这样，才能在保证人类社会继续高效率运行的前提下，实现绝对的和平与秩序。
为了防止静子给整个试验增添麻烦，腾村让千惠担任幼儿园副园长，以控制整个幼儿园。
重伤后的高宽不省人事。杨丰懋命令渔船在一个相对安全的地方靠岸，并马上通知林婴婴到来。他知道这违背了自己一贯的原则，但是不想让林婴婴留下遗憾。
林婴婴以最快速度赶来和高宽见面。
在弥留之际，高宽向林婴婴吐露了心迹：“为了抗战，有些话，我一直想等胜利之后对你说，我也知道你的心思，我一直想告诉你，我想娶你，请你做我的妻子，现在看来等不到了。”
虽然卢局长把一切嫁祸给秦时光，但老奸巨猾的野夫认为"秦时光倒运药品案"并没有那么简单，他勒令俞副局长负责严查此案。
林婴婴虽然强忍着悲痛上班，金深水找机会过来安慰。
林婴婴慢慢地和金深水讲述了自己的身世、自己和高宽的故事。
被日寇强暴后的冯点点(也就是林婴婴)回到家，但见父亲和大部分家人都被吊死在房梁上。而鬼子依然四处在搜寻家中漏网者。幸好高宽赶来，带她脱险，同时找到了冯二虎(杨丰懋)和仆人阿牛。
冯二虎和阿牛决定拉起一支人马以复仇。但高宽告诉他们，与其功归于尽，不如加入共产党，国恨家仇一起报。在高宽的带领下，神枪手阿牛和林婴婴有战略和政治意图地暗杀了很多鬼子和汉奸，名震上海滩。最后他们光荣地加入共产党。
根据形势发展的需要，高宽安排冯二虎、阿牛到根据地报到，林婴婴得到戴笠的赏识，最后又派回南京，到汪伪保安局潜伏。那时，有了一个新名字，林婴婴。
林婴婴的身世，让金深水为之动容，他对共产党人有了进一步的了解。
皖南事变爆发。深爱金深水的革灵各地找到金深水，担心他"出问题"，她告诉金深水："政治上的事情又复杂又危险。我们老老实实做好自己的本职工作就好。共产党的闲事，你可千万不要去管，别一时糊涂，闹到无可挽回的地步。"金深水感到非常苦闷。
革老传达戴笠的命令，务必清剿南京残存的共党地下组织。金深水再次质问："难道我们非要把抗日同胞赶尽杀绝?"受到革老的训斥。革老命秦淮河盯住南京地下党的一举一动。
林婴婴和金深水在一起、金深水为皖南事变一事感到脸红，但他认为这是一次误会， 最终是可以消解的。
林婴婴说："这已经不是误会了。你的组织在出卖我们，背叛国家，杀害同胞，就仅仅因为我们政治信仰的不同。从我那天看到我的同志们被日军送上刑场的那一刻，我清醒了。我开始明白，有些东西，即使你拼命回避它，它却会主动找上你。"
金深水无话可说。林婴婴问了一个非常敏感的问题："你有没有想过加入共产党?"金深水明确表示他不会当叛徒。林婴婴告诉金深水，只有一种人能够被称为叛徒，那就是背叛了自己的原则和信仰的人。但军统现在给金深水的的命令却背叛了他的原则和信仰吗。
金深水最后强调，他既然不能背叛党国，也不能看到自己的同胞自杀残杀。但因为他是革老一手带出来的学生，敬他如父，不能辜负他。
但这次和林婴婴的交流，让金深水感到无比畅快，因为好久没有和人如此敞开心扉交谈了。这次交流，也促使金深水在未来的日子里无可避免地思考国名党和共产党的相关事情。
杨丰懋指示，尽管国民党如此背信弃义，同室操戈，但是我们依然要要以抗日大局为重，兄弟相残只会给日寇留下可乘之机。对国民党，地下党还是要以防为主，能躲的就躲，一些容易暴露的联络点也暂时不要启用，从下次起，接头地点改到城北的春香馆。
但春香馆已经被秦淮河盯上。
千惠以副园长的名义试图操纵幼儿园，遭到静子的抵制。
