北京，风雨如盘。崇祯三年八月十六日，袁崇焕被凌迟处死于北京…袁崇焕府。火光冲天照亮黑夜。众多锦衣卫在某太监带领下冲进袁府，袁家满门惨遭灭顶之灾。袁崇焕旧部孙仲寿、朱国安等及时赶到，拼死救护袁崇焕的儿子——年仅8岁的袁承志。经过与锦衣卫高手安剑清的壮烈激战，死伤多名好手，终于把袁承志成功救出……
十二年后。崇祯十五年。李自成起义军迅速壮大，席卷北中国，已经形成同崇祯政府军分庭抗礼的局面。双方战斗激烈，相持不下。而满清屯兵关外，虎视眈眈，伺机而动。 华山绝顶。袁承志跟随天下第一高手穆人清苦学武艺。穆人清告诉袁承志，袁崇焕旧部组织“山宗”要在他年满二十岁的时候，举行为袁崇焕平反昭雪的誓师大会。穆人清要袁承志下山前去参加山宗大会，然后师徒在南京会合。
木桑道长来考察袁承志的武功。并在袁承志下山之时赠送护身背心。 袁承志下山，途中救了张朝唐主仆。袁承志感慨官兵竟然诬民为盗大肆抢掠，对当下混乱的时局加深理解。张朝唐主仆对袁承志千恩万谢，准备动身回国，听说袁承志要去开山宗大会，主动提出一同前往。 袁承志听到百姓中间流传的歌谣，如“闯王来了不纳粮”、“管叫大小都欢悦”等等，大为感动。袁承志第一次听说了歌谣的作者——李岩这个名字。 山宗大会。袁承志上山。孙仲寿、朱国安等袁崇焕旧部商量奉少主。袁承志明确了替父亲昭雪的使命。但是朱国安力主推翻崇祯的帝位来复仇，而孙仲寿主张通过和平请愿的方式为袁崇焕翻案。山宗两派意见相左，激烈争执，袁承志无所适从，拿不定主意。
张朝唐致辞“黄龙未捣，武穆蒙冤，汉祚待复，诸葛星陨”。 闯王的代表李岩和刘芳亮上山来，希望联合山宗，一同推翻大明王朝的统治。李岩纵论天下格局大势，见解高超，且才华出众，令袁承志敬羡不已。李岩和袁承志夜谈。李岩对袁崇焕十分敬佩，并对他的冤死十分痛心，谈到崇祯皇帝“自毁长城”。袁承志十分感伤，同时对自己的父亲也更加崇敬，因为这些赞美的话是出自李岩之口。 李岩在参加大会的人群中发现奸细，原来是崇祯亲随曹太监派来的卧底，而大批的锦衣卫和官兵已经待命山下，准备把山宗一网打尽。
碧血剑剧照
山宗处置了奸细，紧急疏散，但是锦衣卫高手已经赶到，为首的正是当年带头查抄袁府的安剑清! 锦衣卫追杀，山宗队伍和李岩都要掩护袁承志先走，袁承志施展武功，大家才惊异地发现袁承志身怀绝技。袁承志掩护大家下山，并和山宗相约一个月后会合，地点定在南京。山宗众人逃去，袁承志和安剑清展开激斗。袁承志武功初成，和安剑清势均力敌，不相上下。但是袁承志最终因为经验不足，被安剑清暗算，受伤后跌落下山崖…
袁承志跌落山崖，因祸得福，发现了金蛇郎君夏雪宜藏身的山洞。金蛇郎君已经死去多年，袁承志得到金蛇剑、金蛇锥、武功秘籍和藏宝图。袁承志一边学习修练，一边养伤恢复体力。 安小惠和崔希敏运送闯王的军饷——二千两黄金。途中遇到龙游帮的抢劫。不料温青青半路杀出，抢走黄金。 半个月后，袁承志已经熟悉了金蛇郎君的武功。和山宗等人的南京约期将至，下山。途中遇到搜山的锦衣卫，以及寻宝的棋仙派门人张春九和汪秃头。
袁承志被下三滥的迷香放倒，但是金蛇郎君安放的铁盒毒箭和书页毒药却替袁承志杀死了敌人。 袁承志乘船渡江，偶遇女扮男装的青青，袁承志阅世不深，并未识破。龙游帮帮主荣彩亲自出马，前来阻截青青要分黄金。袁承志帮助青青战胜荣彩，保住了黄金。青青感激袁承志，不由分说就把黄金给了他一半，迅速消失。
温家其实是石梁地区势力雄厚的棋仙派，温家五老更是名震浙南的高手。袁承志找到温家庄，发现温家鱼肉乡里，欺压百姓。袁承志登门退还黄金，这更增加了青青对袁承志的好感。袁承志和温青青结拜为兄弟。温家长子温正对袁承志充满敌意，袁承志莫明其妙。 袁承志终于发现了青青是女子，而且自幼就没有父亲，在温家饱受欺压。青青对袁承志一见倾心，而袁承志对青青也有好感。但是温家长子温正一直喜欢青青，所以才对袁承志充满敌意，而青青则明确表示自己更喜欢袁承志。
安小惠和崔希敏追查到温家，袁承志这才知道黄金乃是闯王军饷，劝青青归还。但是青青不满袁承志和安小惠的暧昧关系，坚决不肯。争执不下的时候，温家五老出面 ——其实他们为官府效忠，蓄意让青青抢劫军饷，不利闯王军队。为了夺回黄金，袁承志和温家五老过招，将其逐一击败，无意中显露出金蛇郎君夏雪宜的武功。温家五老惊怒，原来他们和金蛇郎君有着血海深仇…
