黑三要杨出五十两黄金换取沉默。杨主簿明里答应，暗施黑手，结果，就在英姑领宋慈到其父当年遇难的落马坡时，竟发现了坠落悬崖的黑三尸体。所幸与黑三同行的“六月红”被树枝挂住，保得一命。宋慈从黑三七孔的血色断定黑三死于谋杀，遂将“六月红”带回客栈，意欲从此女嘴里挖出梅城迷案的线索。
英姑无意中说出一番话，揭穿了卢知州的一个谎言，宋慈巧设敲山震虎之计，对卢知州提出要对半年前遇难的竹知县开棺验尸。离开知州府，宋慈和捕头王就被一群黑衣人追杀。幸亏宋慈的岳父薛庭松受命钦差，及时赶到，暗施援手，才使宋慈摆脱追杀……
负伤醒来的“六月红”终于道出真相，梅城县两任知县谋杀案昭然若揭，宋慈向岳父请命收网。大堂上，卢怀德在宋慈无以辩驳的案情推理之下，却狂笑宋慈找不到谋杀孟知县的证据。
谁料宋慈却用惊世骇俗的检验之法，将孟良臣被谋杀后又遭焚尸灭迹的证据从卧尸的地面上验了出来……宋慈初次出山，就建下奇功，令朝野震动，被破格擢升大理寺正六品主事……
太平知县吴淼水仅三天就破得一桩凶杀命案，凶犯曹墨供认因垂涎玉娘美色意欲夺爱而杀了其夫王四，并交出了杀人时所穿的血衣一件。一年后，宋提刑前往太平县视察狱事的路上，将一伙盗贼拿了个人赃俱获，给了鼓吹自己治县有方的吴知县一个难堪。在视察牢狱时，一位给待决死囚儿子喂食的白发老母令宋慈心动。宋慈突然问何故杀人，曹墨脱口而呼没有杀人!
旋即又连连改口是他杀了王四。宋慈疑云在心;吴知县暗暗惊心。是夜，宋慈翻阅案卷，发现太平县疑案多多，愤然难抑。而吴知县却半夜悄悄来到死牢，对曹墨循循善诱，嘱其不得翻供，并许诺：只要坚持原先的供词，可免其一死。
