端妃权衡皇后与华妃两股势力后，夜访甄嬛，对其点明利害并结成同盟。华妃得知甄嬛有孕，惊怒交加，怨恨端妃当年致使自己不能再孕，对端妃羞辱报复不止。
华妃怀疑身边的御医不可靠，请来哥哥年羹尧为自己举荐贴心可靠的大夫。
曾在年羹尧军中效力的名医陈大夫前来为华妃诊脉，太后身边的孙姑姑旁敲侧击，让陈大夫明白华妃无法怀孕的缘由;陈大夫在华妃面前不敢吐露半句口风，与宫中其他太医一样保持沉默。
皇帝回宫，得知甄嬛有孕大喜过望，封甄嬛为莞嫔。皇帝感叹自己膝下子嗣炎凉，嘱咐皇后好生照顾甄嬛，不得伤害，皇后胆战心惊。
陵容赠甄嬛一瓶家传的舒痕胶，告知此药去疤效果极好。而陵容却在此药膏内放入大量的麝香，孕妇长久使用必将伤及腹中胎儿;甄嬛懵然不知，仍视陵容为真心姐妹。
甄嬛被正式册封为莞嫔，在宫中地位与日俱增。
皇帝来见眉庄，见眉庄仍有心结且态度冷淡，皇帝讨个没趣，去探望甄嬛。甄嬛装睡，被皇帝察觉。皇帝发觉甄嬛的伤痕已经淡了许多，感叹甄嬛美貌世间无双。
皇帝提到江慎、江诚两位太医收受宫女太监贿赂，毫无医德可言，甄嬛借机举荐温实初，并告知皇帝治疗时疫的方子乃二江窃取而来，皇帝起了杀意，派手下血滴子暗中除掉二江。华妃得知此事替二江向皇帝抱屈，皇帝表示定会厚葬两人。
皇帝为甄嬛绘制“姣梨妆”，后宫内外盛行。甄嬛生辰之际皇帝大摆宴席，引来众妃嫉妒。果郡王真心一片，别出心裁，用满湖盛开的莲花博得甄嬛一笑;席间更吹奏《凤凰于飞》之曲，表达皇帝与甄嬛夫妻恩爱、和鸣铿锵之意。
华妃听闻淳儿即将获封贵人，心生杀机;曹贵人暗叹华妃不分主次，自乱阵脚。淳儿捡拾风筝时无意撞见华妃收取他人贿赂，曹贵人使计令淳儿暴露身份，华妃杀人灭口。曹贵人报信于甄嬛，为自己谋得后路。甄嬛发现淳儿死因蹊跷，决意报仇。
西南战事大胜，年氏一族风光无限，皇帝更是另眼相看，答应晋华妃位份。
华妃意在后位，咄咄逼人使皇后在众妃面前颜面扫尽。皇后探知皇帝一时不会对付年氏一族，只得自己加紧谋划。
内务府预先备下皇贵妃服制送与华妃试探其态度，华妃不疑有诈，欣然收下。皇帝闻风不悦。
年羹尧以军功自傲压制朝中文官，兴建王府穷奢极欲。年羹尧夫人发病，年羹尧命人强行请走宫中所有御医为爱妻诊治;皇后深夜头风病发，却找不到一个御医，皇帝闻讯大怒。次日百官闻风谏言，皇帝却一味宽纵，更出言安慰年羹尧。年羹尧更加骄纵，百般压制甄远道。甄嬛夜读《郑伯克段于鄢》试探皇帝心意。
翌日，华妃满心欢喜等候晋升，却得知皇帝仅晋封自己为贵妃，而非位同副后的皇贵妃;华妃这时才意识到自己太过心急。
陵容偶遇落寞的齐妃，暗示齐妃孕妇忌讳夹竹桃。护子心切的齐妃正中陵容的圈套，亲自做了掺有夹竹桃汁液的栗子糕叫人送给甄嬛，被陵容当场假意揭穿。
皇后急招齐妃，令她下跪自首。
齐妃祈求皇后宽恕，皇后借机夺取抚养三阿哥的权力。齐妃无奈授人以柄，只得听命于皇后。槿汐感觉此事有诈，告诫甄嬛要留意陵容，甄嬛却不以为然。
皇后与皇帝离宫祈福，华贵妃独掌六宫，大权在握。甄嬛有孕在身，体弱不适，华贵妃令太监周宁海前去碎玉轩请甄嬛到翊坤宫听事;甄嬛自知此行凶多吉少，为了避免与华贵妃发生冲突，以大局为重，只得前往。
华贵妃借口甄嬛怀有身孕恃宠而骄，责罚其烈日之下跪于宫外诵读《女诫》，眉庄挺身而出保护甄嬛，被责罚一同下跪;陵容假意口头哀求，言语更加冒犯华贵妃。浣碧在一边焦急万分，连忙赶去太后宫中报信，奈何太后病重不能见人，只得求助于进宫看望太后的果郡王。
烈日炎炎下，甄嬛体力不支晕倒在地;果郡王不顾禁忌，擅闯翊坤宫救出甄嬛。华贵妃发觉甄嬛下跪处有血迹，大吃一惊。
果郡王抱甄嬛回到碎玉轩，手中全是血，甄嬛似有小产迹象。苏培盛赶赴天坛告知皇帝甄嬛出事了。
甄嬛久跪小产，皇帝与皇后闻讯策马赶回宫中。甄嬛失子，皇帝自责不已，皇后假意安慰。
华贵妃得知甄嬛小产自知罪孽深重，在曹贵人劝说下只得脱簪请罪。
皇帝大怒，废其华贵妃之位，褫夺封号，降为妃位，并责罚其每日正午跪于翊坤宫门外两个时辰思过。
皇帝顾及朝政与年羹尧的势力，不能依甄嬛所愿杀掉华妃，甄嬛心灰意冷。
年羹尧得知妹妹华妃失宠后上书谏言，向皇帝直言冷落妹妹会使年氏一族寒心，令其地位不稳。皇帝处于两难境地，找来果郡王探其口风，果郡王以“不在其位，不谋其政”为由推脱，消除了皇帝的疑心。
甄嬛沉浸在失子之痛中，不能自拔，槿汐劝慰，甄嬛埋怨皇帝的言语被前来探望的皇帝听到，止步不前。皇帝心中郁结，来到太后处，诉说是自己当年赐给年妃的欢宜香导致甄嬛流产的，自责不已，太后宽慰皇帝。
