黄飞鸿返回中原找解药 阿妹拼死搏斗身先亡
没有援兵，刘永福带着仅存的将士们拼死抵抗，但兵力悬殊太大，五花部落的成员们带着他们躲进树林里，准备和日本军队打游击战。
桂向荣问黄飞鸿打完仗后他有什么安排，黄飞鸿想念黄麒英和十三姨。桂向彤劝黄飞鸿回广州老家，并告诉他载鸷也很担心他，其实当时他从沙滩上救出黄飞鸿也是载鸷安排的。
日本人久攻五花部落一直未成功，于是偷偷在五花部落的溪水里下毒，大多数人都中毒了，浑身奇痒无比，严重的皮肤溃烂。
这时日本人用清水和解药来引诱他们投降，并让他们交出刘永福。有一些人无法忍受痛苦，冲上前去抢水喝，结果却中毒身亡，原来日本人根本不在乎他们是否投降，他们的目的就是杀光岛上的中国人，桂向彤等人气愤急了，一怒之下杀了送水的日本人。
黄飞鸿配出解毒的药方，但岛上的药材有限，还差几味药，黄飞鸿只能先试试。黄飞鸿的药只能压制一时的毒性，无法除根，大家的情况越来越严重越来越严重，连阿妹也中了毒。
黄飞鸿以身试毒，偷偷做了木筏，准备潜回中原找解毒的药材，却被刘永福他们误会他要私自逃回中原，阿妹的哥哥让黄飞鸿带着阿妹一起走，黄飞鸿却告诉他他对阿妹不是男女之情，不能带他一起。黄飞鸿告诉刘永福，他回中原就是为了找到解药。解除误会后，刘永福等人给黄飞鸿做了一个更大的木筏，亲自送他离开。
福建总兵陈太川一心想找载鸷私自偷取佛心的把柄，好向老佛爷邀功，但载鸷心思缜密，滴水不漏，陈太川每次都是无功而返。带着老佛爷的指令来监视载鸷，没占到便宜，来查佛心
黄飞鸿来到福建的睿亲王府寻求帮助，没想到睿亲王竟然是载鸷，他质问载鸷为了一己私欲害死了众多的无辜将士。载鸷给黄飞鸿看自己的用佛心换来的战舰——克复号，并告诉了黄飞鸿自己想振兴大清的计划。黄飞鸿越来越看不懂他了，总是用错误的手段做一些看似正确的事。载鸷解释自己身在其位，行事必须要耍一些手段。虽然无法认同载鸷的行事手段，但载鸷所做之事都是为了国家的未来，黄飞鸿原谅了载鸷，请载鸷帮忙寻找解药。
黄飞鸿在载鸷去找解药之时，偷偷拿走了他的印章。后来载鸷才知道黄飞鸿带着解药和他的印章私自出海，载鸷急忙带着人去海边阻止黄飞鸿出海。
正愁抓不到载鸷把柄的陈太川发现黄飞鸿用载鸷的印章私自出海，下令用炮弹击沉黄飞鸿的船，并想通过此事大做文章，向老佛爷告状。载鸷及时赶到，当众杀了陈太川，放走了黄飞鸿。
日本人再次对五花部落进行了强攻，黑旗军和部落成员齐心协力，奋死搏斗，结果因兵力悬殊全军覆没。当黄飞鸿带着解药赶到时，已是一片狼藉，阿妹临终前问黄飞鸿到底有没有爱过她，黄飞鸿却不知如何说出口，阿妹最终含泪死在黄飞鸿怀里。
载鸷杀了陈太川后，给他扣了个通敌卖国的罪名上报给老佛爷，原以为事情就这样被隐瞒住了。谁知樱花夫人手下有一名间谍长期潜伏在清政府的朝廷里，把载鸷偷取佛心，私自杀死陈太川的事上报给老佛爷。老佛爷下旨把载鸷革职查办，并把他关进了刑部大牢。
