1945年，日本投降在即。游学归来的刑侦专家程慈航在码头遭遇了一次惊险的暗杀。原来，日本和国民政府的特务都在对一只铁箱展开争夺。里面装的正是日军细菌武器绝密档案。

　　警察厅厅长莫采石不着痕迹地将铁箱存放在了档案馆的特密室内。由于内奸刘阿常的出卖，当晚档案即被盗，引发各方人士的一系列的凶杀抢夺。档案失窃，警察厅刑侦处处长严达庆办案不力，外界压力极大，这令警察署长霍然火冒三丈。美国人也对档案非常感兴趣，美国顾问团一名助理哈金斯火速赶来进行调查，不想档案馆特密室肖主任当夜被杀，线索中断，令案情更加扑朔迷离。

　　警员关天平、欧阳倩等一众人等均期盼着程慈航能够接手此案。了解到此案牵涉到日军细菌武器的资料，程慈航立即向莫采石请战，要求经办本案。正为办案焦头烂额的霍然大喜过望，随即同意程慈航为警界特聘的布衣侦探身份加入首都警察厅，负责此案侦破。

　　程慈航上任后，处处受到严达庆的刁难。他在欧阳倩等人的协助下，先后侦破了多起要案，也受到了霍然之女霍蜜儿的垂青。欧阳倩对程慈航暗生情愫，但苦于自己的特殊身份，一直不能全心去爱。谁都想不到档案已被莫采石藏在程慈航家的座钟之内。

　　莫采石处处设障要程慈航远离真相，但程慈航通过霍蜜儿已经查到侍从室。欧阳倩不得不在职责和心上人之间作出艰难选择，而霍蜜儿却始终追求着程慈航，甚至不惜为他顶罪而被捕入狱，感情的天平渐渐倾斜……

　　程慈航发现身边的人疑点重重，刘阿常原来是莫采石的一个潜伏的卒子!莫采石栽赃欧阳倩，让程慈航前去抓捕。程慈航坚持欧阳倩及许多爱国人士无罪，莫采石大骇。

　　时局越来越乱，国军在正面战场上节节败退，官员人人自危。欧阳倩组织人手将负责的孤儿救助机构向南迁，这时，有共产党的地下组织主动伸出援手，希望帮助她将孤儿院北迁至解放区安全的地方。

　　为争抢档案，程慈航众人和不明分子展开枪战。欧阳倩舍命保护程慈航，中弹倒地，程击毙蒙面人，发现竟是严达庆。在就医路上欧阳倩死去，程慈航嚎啕痛哭。

　　追回的铁匣子经证实，只是一只赝品。程慈航一直在琢磨档案的黑幕究竟意味着什么。但很快刘阿常被人暗杀在玄武湖边。从留下的线索中，程慈航找到一条线索，直指莫采石!

昙花梦剧照

　　国民党节节败退，上峰下台，莫采石见大势已去，和哈金斯谈判。后者承诺只要莫采石能弄到档案，美国政府将安排他和程慈航的下半生荣华富贵。

　　为了安抚程慈航的情绪，霍蜜儿悉心照顾他的起居饮食，并憧憬着二人去美国后的夫妻生活。和哈金斯达成交易后，莫采石回到办公室的里间，打开文件柜时却发现铁匣子不翼而飞，就在他惊恐万状走出里间时发现程慈航坐在沙发上。程慈航从包里拿出铁匣子告诉莫采石真相已被他了解。他冷冷地告诉莫采石，上峰比他玩得更高明，因为这只铁匣子也是假的，真的档案一直控制在上峰自己手里。莫采石坚决不信。他用特制钥匙打开铁匣子，惊讶地发现果然如此。程慈航告诉他真的档案就在城外的藏经楼。

　　程慈航和霍蜜儿伪造证件去藏经楼调取档案。莫采石准备乘坐军机赴美，发现自己的中正剑被盗，联想到程慈航已经开始行动了。此时赶来的侍从室的人发现档案失踪，沿路追来，莫采石一不做二不休下令将他们杀掉灭口。程慈航继而被抓。莫采石在安排离开的事宜。

　　关天平私放程慈航。程和霍蜜儿来到莫采石办公室阻拦他离开……在军用机场，哈金斯和莫采石终于等来程慈航的身影。哈金斯高兴地对程慈航说想通了就好，以后在美国大家有时间修复曾经的不快。程慈航面无表情地登上了军用飞机。飞机驶出跑道，霍蜜儿惊慌追来，见飞机启动，吓得一屁股坐在地上。原来程慈航回家将她绑在椅子上，自己提着一包炸药上了飞机。飞机在起飞后爆炸，机上无人生还。程慈航与莫采石同归于尽。霍蜜儿在解放前夕随霍然离开。

　　数月后，霍蜜儿在香港顺利产下一子，取名程继航。程慈航最终摧毁档案，

　　昙花梦相关信息

　　民国侦探悬疑剧《昙花梦》根据香港女作家陈娟的同名小说改编，由编剧杨骏执笔，导演曾晓欣执导，昙花梦剧情讲述了日军投降后，一份装有日军生化武器资料的五九档案离奇被盗，由此引发了一场离奇而惊险的侦探故事，充满悬疑色彩。

　　在剧中，有身份神秘的欧阳倩想爱却不能相爱的纠葛、有官二代霍蜜儿(郭晓婷饰演)为爱奋不顾身的果敢、有江湖女子若有似无的暧昧，程慈航这个海归侦探成了众女神眼里的香饽饽。乔振宇表示，相较于原小说的情感设定，此版剧本有了非常大的改动，所有的情感最后都有了升华，爱情也不再是单纯的你侬我侬。而网友们一直都很关心的男主角最终的情归处，也将保留成本剧的一大疑点直到开播后来解答。

　　如果说爱情是软装，那么情节才是硬货。剧中为追查装有日军生化武器资料的档案，程慈航既要面对日军大佐中田布下的天罗地网，刑侦处处长严达庆(王品一饰演)的百般阻挠，又要揣测莫采石(巫刚饰演)的高深莫测，还要与他的老同学、对五九档案觎觊已久的美国特工哈金斯斗智斗勇，更要与潜伏在江湖组织锦线中的日本间谍刘振亮(周翔饰演)博弈较量。而在这过程中，一个疑点牵出一个案件、一个案件揪出一个卧底，似乎每个人都有着双重身份。就连身边至亲至爱的人，都有着不为人知的秘密。情感极大程度地挑战着正义。