正当诸位英雄要冲进行宫之时，不料却从行宫四周冒出许多军队来，与剩余反王军队恶战一番。然李元霸在打斗之时被击头部，开始癫狂，竟杀起自己人来。王伯当在徐茂公的指挥下，箭射其气穴，李元霸无声倒下。秦琼率领众人终杀退最后的隋军来到行宫门口。罗士信将宫门撞开，却被门内乱箭射死，战场之相，惨不忍睹。秦琼怕伤亡过重，命人撤退。
罗成告别父亲，随秦琼回瓦岗，准备重整旗鼓，再战隋朝。罗艺则回北平府。
杨广损兵折将，手中已无兵权，自知死期降至，感慨颇多。宇文化及操控军队，软禁杨广，更要除掉北平王。宇文化及、宇文成都率兵半路截杀罗艺，罗艺惨死宇文成都手下。宇文父子，赶往北平府，欲夺北平府之兵权。罗松带王妃逃走，被宇文化及拦下，罗松、王妃俱死于宇文父子手下。宇文化及既得北平府兵权，下一步便要除掉杨广，逼他交出玉玺。罗成预感家中有事，急忙往回赶，却发现满门皆死，难以消受，更被宇文成都手下抓住，押往扬州。
夏王窦建德得知铜旗阵一役，隋军与反王皆是损失严重，此时正是他渔翁得利之时，于是同女儿窦线娘一起直下扬州，夺取玉玺，逐鹿中原。途中，正遇隋军押罗成前往扬州，于是出手相救，不想正遇秦琼等人也来相救。双方合力将罗成救出。窦建德与程咬金商议，一同前去扬州，除掉昏君。
窦线娘为受伤的罗成送药，处处表示关怀之意，单盈盈有些吃醋。
杨广观琼花，忽一阵邪风吹来，琼花飘零，杨广深感扫兴，此时令狐行达来报，请杨广还朝。
杨广趋至殿中，却见众臣相逼，杨广质问众人为何反他，众臣言是为百姓反。宇文化及前来，杀死杨广之子杨杲、爱妃朱贵儿，逼迫杨广。杨广悬梁自尽。宇文成都不肯随父取得玉玺，反而杀出寝宫，以报圣恩。宇文成都被李元霸所杀，顿时天地迷蒙，忽降大雨，李元霸举锤欲砸死雷公，却将自己砸死。
萧后将玉玺交予宇文化及，想要随宇文化及一起逃走，不料半路杀出程咬金，程咬金杀死宇文化及，夺得玉玺。窦建德则将萧后带回宫中。秦琼率兵攻入行宫，隋朝彻底瓦解。与此同时，李渊率兵起义，攻占长安
李建成、李元吉怂恿父亲出兵瓦岗，夺回玉玺。李世民认为当下之计不在玉玺之争，而在招兵买马，壮大实力。李渊听从李世民之计。瓦岗既得玉玺，单雄信则以为应立即号令天下，直攻长安，徐茂公等人则认为时机未到。然而，李密深夜召唤王伯当，命王伯当用玉玺换得萧后，王伯当不解，但答应为他办妥此事。
程咬金、裴翠云则在为罗成、单盈盈张罗婚事，罗成态度不明，再加上窦线娘此时来到瓦岗，单盈盈以为罗成变心，不解罗成心思，心中十分郁闷。
窦线娘对罗成表白，罗成婉言拒绝。单盈盈找罗成谈心，罗成说得不痛不痒，让单盈盈甚感憋气。然见窦线娘前来，罗成不理盈盈，却与窦线娘讲话，单盈盈认为罗成与窦线娘已有儿女私情，并赌气发誓要与罗成一刀两断。窦线娘得知玉玺已到夏王之手，久留无益，于是辞别瓦岗。但罗成、单盈盈之结，尚未得解，玉郡主劝慰盈盈，盈盈难消心头之气。
瓦岗众人得知李密用玉玺换得萧后，愤懑难平。萧后知瓦岗之人必会反她，劝说李密一定要趁机将政见不合者除掉，以绝后患。此时，单雄信怒发冲冠，责问李密为何如此淫荡，将兄弟们用命换来的玉玺拱手让人，不图上进却耽于女色。萧后从中挑拨，李密怒斥单雄信想要玉玺，不过是为报私仇。单雄信怒杀萧后，被秦琼等人拉住。单雄信一气之下，带着单盈盈离开瓦岗。翟让听说玉玺换萧后之事，前来劝说魏王将玉玺换回，却遭毒手，惨死李密手下。李密荒淫无度，不理政务，瓦岗众人之心日渐凉薄，渐自寻出路。
徐茂公、魏征痛恨李密为人奸诈，便商量着离开瓦岗投奔大唐。二人在城墙上赋诗几句，掷笔而去。此后，瓦岗不断有人离去，渐成一座空城。李如辉、齐国远、谢映登等人亦离瓦岗而去。秦琼、程咬金、罗成、王伯当等人仍留在瓦岗，期望李密能够悔悟，重建瓦岗。然瓦岗衰落之势，已难以挽回。
