于谦下狱以后,王振更加肆无忌惮,他诱哄英宗砸了“内官不准干预朝政”的御碑,在瓦剌犯边时又怂恿英宗御驾亲征。英宗仓促凑集五十万大军,随带文武百官及三宫六院护驾同行。吏部尚书王直对英宗御驾亲征深感不安,去狱中探望于谦,于谦断定英宗此番出师必然凶多吉少。
于谦向太后阐述了对当前战局的精辟见解,太后让于谦给英宗写一份认错书以便获得皇上的宽恕,于谦写下了著名的《石灰吟》。明军此行连遭伏击,王振惧怕,动员英宗班师回朝。回撤途中,王振临时又改道而行,贻误了军机,大军宿营驻扎在无险可依、无水可饮的土木堡,终至酿下大祸。
明军被瓦剌军团团包围。五十万大军顷刻间土崩瓦解,满朝文武百官死于战场,英宗被瓦剌军生擒。石亨从战场中杀出一条血路,回朝报告全军覆没的消息。孙太后下旨将于谦免去死罪,回朝主持危局。于谦立英宗之子为皇太子。孙太后封于谦为兵部尚书,主持军机大事。
瓦剌太师也先挟英宗一路攻城掠地,明军守关将士见皇上驾到,不得不打开城门接驾,瓦刺大军直往京城杀来。郕王表示要以身赴难代兄受囚,使于谦等人深为感动。孙太后对郕王不信任,欲再度垂帘听政,孙太后提出将女贞赐给于谦为妾,于谦决然不从。