武皇对自己下了罪己诏，把自己关在了上阳宫里，已经多日未上朝了，就连张柬之大人都不能允许进入，所以大臣们都在殿前等待狄仁杰带他们去上朝。而现今武三思和武懿宗二位大人说是陛下降旨代理朝政，但各大臣都没有见过圣旨，所以都对此事很是怀疑。而张柬之张大人此刻在殿中以求面圣。狄仁杰听了众人之言后，便前行入殿。狄仁杰入殿后向二位武大人表示自己想见陛下，但不想武三思和武懿宗两人却始终将狄仁杰和张柬之阻挡在殿外，斥责狄仁杰现今的重任是救灾，至于面圣之事现不可循狄仁杰的心意。狄仁杰却执意要面圣，随后二位武大人便罚狄仁杰休假三个月。
张大人从密道来到了狄仁杰府邸，与狄仁杰共商武皇闭门不出、委托他人代理朝纲一事，而狄仁杰则让张柬之马上潜入上阳宫中查清此事。夜里，元芳便乔庄进入上阳宫，欲一探究竟，但不想探查途中却遇另一黑衣人。二人在搏斗中引来了宫里的侍卫，在混乱中另一黑衣人却救了元芳，且黑衣人知晓元芳的身份，并让元芳可以为他引见狄仁杰，他会向狄仁杰阐述上阳宫发生何事。
狄仁杰府邸中，狄仁杰通过黑衣人呈现的黑石得知此人乃是国师。而国师迎鵺造访是想寻狄仁杰帮助解救患者，只因国师也无法解救此人。狄仁杰思前想后，虽此举颇为危险，但现今的情况，自己也只能以身犯险了。随后，狄仁杰从元芳处得知上阳宫果然有蹊跷，上阳宫无端出现一颗石树，实乃诡异。
狄仁杰随着国师去往患者处，但国师却要求狄仁杰和元芳带上眼罩以保安全。在途中，狄仁杰一直暗算中路途的特点，以求对此能知一二。到达目的地后，原来费力寻狄仁杰救患者的人乃是太平公主。太平公主带着狄仁杰去到了公主府邸的密室里，不想密室内的患者竟然是武皇，太平公主直言昨日武皇还有些许意识，但今日却意识全无了。狄仁杰查看后便言，此乃中毒的迹象，随即便为武皇施针营救。
狄仁杰从太平公主处得知，武皇在侍卫于上阳宫前发现石树后前去查看，不想在武皇查看过程中却身中奇毒了，太医也尚未查明毒源。而奇异之处就是在场众人只有武皇和武皇的几名贴身婢女中毒了，其他人都无大碍。听此，太平公主顿觉不妥，随即便立刻将武皇连夜带走。就在武皇前脚离开皇宫，这后脚二位武大人便深夜前来了，更执意要夺回武皇。好在太平公主心思缜密，早就将陛下护送到太平府了。
