左宗棠在弥留之际，念念不忘台湾建省，但还是未能等到皇帝亲允建立台湾省的好消息就殉职于福州任上。朝廷得此消息，纷纷悼念左宗棠，并在京都设立专祠祭奠，醇亲王代天子致祭。 西太后一面应允建立海军衙门，一面提出修建园林供她养老。
醇亲王无银子，只好求助李鸿章。建立完善的海军需要花费大量银两，而修建园林更是花钱如流水，李鸿章为此也一筹莫展，此时孙毓汶提议设立“海防捐”，借此敛财，以解办海军和修园林之难。 光绪十一年九月初五，清廷终于下旨台湾改为行省，命刘铭传为首任巡抚。
于第二日，设立总理海军事务衙门，醇亲王为总办大臣，李鸿章为会办大臣。1885年10月12日，台湾府终于改为台湾省。 李鸿章让刘铭传出任海军会办，刘多次婉拒。李鸿章打算上折请奏，孙毓汶则自告奋勇，认为有能力让刘铭传回心转意。
台湾巡抚刘铭传走马上任后，事事皆难，福建和朝廷均不拨军饷，万般无奈之下，刘铭传只得与唐景崧共同写旨上奏朝廷，缓建台湾省。
正在此时，偶遇孙开华，得知左宗棠临终遗命“福建原先每年给台湾的四十四万两军饷，一切照旧”。刘铭传大喜，无奈缓建台湾省的奏折已递上，孙开华买通管事太监，把奏折拿回。 刘铭传上任之前向李鸿章告别，并表示将重新利用当年被沉入海底的那条铁轨，为台湾建造第一条铁路。
李鸿章挽留刘铭传的希望破灭，只得将写好的折子付之一炬。同时，刘铭传上折保荐唐景崧为台湾兵备道，并弹劾现任台湾兵备道刘璈于台湾战事之时不闻不问、有饷不发、坐观成败。醇亲王因事情棘手，暂压奏折。
李鸿章与德璀琳商谈大清购买巡洋舰事宜时，北洋水师管带邓世昌忽然闯入，恳请派他去英国监造兵舰，李鸿章被感动，欣然同意。此时，日本也在商议派何人去法国监造他们的舰只。
日本派海军大佐伊东佑亨去法国监造舰只，他与邓世昌相遇在客轮上，两人经历了一番唇枪舌战。 刘永福率军回到广西，却无实权，黑旗军将士们一个个离开，连曾阿富也告长假返乡侍奉哭瞎双眼的老母亲，母子相见，泪如雨下。
面对弟兄们的离去，刘永福心如刀割，却无能为力。 台湾建省，众人免费品尝当地的“国姓爷鱼粥”，以示庆祝。 刘璈得知刘铭传上奏弹劾他，便恶人先告状。经朝廷商议后，令闽浙总督杨昌濬彻查此事，杨昌濬派王诗正亲往台湾私下调查二刘互参一事。
王诗正拜访四品京卿林维源，恰逢，刘铭传来与其商讨如何恢复基隆煤矿之事，从两人的谈话中，王诗正已清楚事情真伪。王诗正据实以报，刘璈本想略加贿赂杨昌濬以平息此事，却适得其反，刘铭传终还清白。
唐景崧升任台湾兵备道，与同僚共庆祝，酒醒后发现红颜知己紫玉已经离开。
