李鸿章一行到达日本马关,伊藤博文提前会见了李鸿章,拒绝了他的停战请求。次日会谈正式开始,伊藤博文表示同意停战,但必须占领山海关和天津。李鸿章急电北京请旨,翁同和指责李鸿章卖国,光绪皇帝与恭亲王商议后决定不谈休战,直接议和。
日本,伊藤博文接受李鸿章提出的“休战免议”,但表示现在条约正在抄写修订,并拒绝向李鸿章透露条约概要。 陆奥宗光对李经方表示日本即将进攻台湾,此时却突然接到李鸿章遇刺的消息,并且李鸿章拒绝让李经方送他去医院。
伊藤博文以政府和个人的名誉保证,一定尽快查清。伊东佑亨向大本营报告,舰队部署完毕,准备进攻澎湖列岛。刺杀李鸿章的凶手被日本警方抓获,伊藤博向天皇表示竭尽全力让李鸿章打消回国的念头,天皇指示马上令联合舰队开战。
日军不宣而战,澎湖军民血战死守。唐景崧拒绝了刘永福要求守台北天险的请求,命其镇守台南,孙毓汶向光绪皇帝汇报,日本同意休战十五日,但澎湖列岛和台湾不再其列。
收到日本的割地赔款方案,光绪皇帝命李鸿章赔款限一万万两之内,辽东只能割鸭绿江一侧;台湾只能割澎湖列岛。中日双方的谈判陷入僵局,伊藤博文提出最后通牒,限三日内签约,否则进攻山海关,李鸿章一边向北京请旨一边暗通法、德、俄等国家,希望他们出面斡旋。
王文韶接任北洋竟查出北洋库里尚存余银八百多万两.光绪皇帝得知后大怒。 伊藤博文对李鸿章 “只割澎湖不涉及台湾”的提议,不予采纳。养心殿内,众大臣群情激昂,认为兵费不可赔,辽东台湾不可让,纷纷要求迁都再战,而西太后则不肯迁都。
李鸿章跟伊藤博文就赔款的具体数额进行激烈的争论,伊藤博文寸步不让。最终李鸿章在最后的时限内终于签署了《马关条约》。刘铭传收到李鸿章的书信后,决定速回台湾。
翁同和收到丘逢甲的血书,被台民乡绅誓死保卫台湾的精神深深打动。北京都察院门前台湾举子汪春源与天下十八省举子联名保台,全国十八省的举子也纷纷联名罢考,要求皇上拒约再战。
西太后听说英国人有意以十亿英镑租金租借台湾,命张之洞紧急约见英国领事,但得知英国租借台湾的可能性几乎为零。 光绪皇帝得知天津驻守的六十营兵因为洪水死伤无数,无法来援,悲愤异常。皇上终于用玺,李鸿章命李经方即刻辞官。
科士达冒雨拜访李鸿章,带来俄法德三国原则上同意对日本进行外交干涉的消息。 三国干预下,清廷追加三千万赔款,日本归还辽东,睦仁天皇十分不满。俄德法三国借机进一步索取更多在华利益,将触角伸向内陆的西北西南地区。
台湾在籍官员、地方士绅闻知辽东归还,齐集抚台衙门,要求效仿此例,再加赔三千万两银子,赎回台湾!光绪皇帝得到消息后,命李鸿章和孙毓汶与日方交涉。日方表示,台湾是日本走向亚洲的生命线,就是再追加两万万赔款,也不能退还。
唐景崧收到圣旨,命他率台湾文武百官即刻内渡,回京复旨,但唐景崧向台胞表示要带领全台军民,抗争到底,誓死保台!