武太后在洛阳拆毁了乾元殿，下令由薛怀义建造明堂。武承嗣为了制造舆论，造了一块写着“圣母临人，永昌帝业”的“瑞石”，以象征武太后荣登九五之尊乃是上天之意。武太后借这个机会，封山神，封水神，加尊号，封王孙，为实现自己的政治抱负做好了一切准备。
终于，李家宗室成员们再也忍受不住了，他们知道，武太后下手将他们除灭，似乎只是一个时间问题。唐室王公之间彼此密书往来，谣言四起，除了在“如欲活命，勿来京都”一项上达成了一致意见之外，似乎也没有什么更好的应急办法。
起兵征讨的信号是由韩王元嘉之子、通州刺史黄国公首先发出的。他伪造了睿宗的玺书，内容是“朕被幽禁，尔等宜各发兵救我……”
李贞之子琅琊王李冲情急躁，鲁莽，他立即致函各王迅速进兵京都，自己则带领刚刚招募来的五千兵勇率先攻打济州。
当琅琊王冲起兵的消息传到神都洛阳，武太后并未张皇失措。她命张光辅为督军节度，率领十万大军西出洛阳，平叛诸王之乱。
平息这次叛乱仅用了二十天就大获全胜，叛将一个被手下效忠朝廷的部将所杀，另一个自尽身亡。武太后借这个机会穷寇亦追，将宗室中与叛乱有关的人一律严惩。经过这些面对面的较量，宗室成员们再也不敢小觑这位女性了，朝臣们也越来越敬佩眼前的这位执政者，朝廷内外，人心思定。
讨武之乱在这么短的时间内即被平灭，也出乎武皇的预料。这次事变中泄露出来的某种信号使武后兴奋不已，李唐王朝看来的确气数已尽，尽管叛军打出了匡复唐室的旗号，但天下臣民竟无人响应，它使武皇清晰地看到了人心的向背。
在叛乱之前蠢蠢欲动，在发轫之际左顾右盼，力求自保的诸王宗室未能逃脱厄运，韩王元嘉、鲁王灵等人被押回东都，在秋官侍郎周兴的逼令下，相继自杀。
十二月二十五日，武皇在洛阳南效的“圣图泉”畔举行了盛大的拜洛典礼。在破晓的晨光中，洛水徐徐东流，武皇峨冠博带，迎风而立，向着冥冥之中洛神拜谢祈祷。几乎在拜洛大典举行的同时，一场更大规模的杀戮也在迅速进行之中：
霍王元轨、纪王慎在流放途中被杀;
东莞公融及江都王绪被斩于曹市;
济州刺史薜顗、其弟薛绪被杀后，尸体暴晒示众;
常乐公主在狱中饮鸩自尽……
明堂建好了，武太后将它命名为“万象神宫”。她身着皇帝冕服在明堂布政，接受百官们的朝贺。
武后的威望已与在世时的高宗一样，令万众仰止。此时有人劝她称帝，武后拒绝了，她认为还不到时候。从徐敬业起兵反叛这件事当中，武后深知“名不正而言不顺”之累，她要从一个看家的，逐步变成一个真正的当家人。任用酷吏，就是为了加速实现这种改变。
载初元年七月，在明堂潜心修行的十位高僧联名向武太后进献了一部《大云无相经》，据《大云经》所载，武太后作为当今圣母，实为净光天女下凡转世，当王天下。武太后即刻将《大云经》颁行全国各寺院，并饬令在洛阳和长安修建大云寺，为收藏佛教经典之用。《大云经》的注疏者，云宣和尚等九人均被赐紫红袈裟，位袭三品县公。
九月，长安人傅艺游率九百人长途跋涉来到洛阳，在洛阳宫门外恳请武后登基，傅艺游向武太后奏道：“李唐运数殆危，改唐为周势所必然，当今太后为千古一人，光风霁月，上应天意，下合民情，理当即速登基……”武太后深为感动，她虽然照例谦谢不受，但还是将傅艺游封为鸾台侍郎。
