袁世凯敦促隆裕退位，承诺诸多优厚条件。隆裕退位，袁世凯就任共和国总统，组织内阁政府。
中华民国临时参议院在南京投票选举袁世凯担任临时大总统，但孙文坚持要求袁世凯赴南京宣誓就职，袁世凯担心身处南京会受制于孙文，一方面答应孙文的要求宣称即刻奔赴南京，一方面授意曹锟在北京制造混乱，以寻求时局不稳不能离京的借口。
蔡元培被其蒙蔽，答应向参议院解释，准许袁世凯在北京就职。
蔡元培等向众议员介绍有关迁都事宜的报告，引起了孙文的顾虑，从而决定必须制订一部能约束总统的根本大法。《临时约法》定立，孙文退位，袁世凯正式就任大总统，唐绍仪就任总理，组建内阁。
然而，袁世凯处处制约内阁权力，在许多事情上和唐绍仪反向而驰，甚至替唐绍仪准备了《辞职书》，唐绍仪愤而辞职，同盟会阁员随之全体辞职，第一届内阁宣布倒阁。
同盟会阁员全体辞职，引起孙文不满。袁世凯提名新内阁总理陆徵祥重新组阁，却被参议院否决。袁世凯惺惺作态，一边假意再次组阁，一边对议员们威逼利透。
武昌起义的元勋张振武会见孙文，对黎元洪的倒行逆施痛加批斥，提出发动"二次革命"。袁世凯对此事十分关注，让张振武赴京解释。黎元洪密电袁世凯，列举张振武十五条罪状，请袁世凯除之而后快，却被袁世凯识破这是"借刀杀人"之计。
